近年来，随着市场竞争的不断加剧，企业发展不断受到挑战，依靠会计舞弊牟取利益的行为日益增多。注册会计师作为独立第三方，出具的审计意见是否能真实有效的反映企业的会计舞弊遭到公众的质疑，注册会计师的信任度也受到严重破坏。本文首先从理论出发，运用委托代理理论和博弈论阐述会计舞弊公司的审计意见及其影响因素。其次，在参考了国内外研究文献的基础上，选取了2008年至2014年在证监会网站上被处罚的上市公司的数据为样本，构建二元Logistic回归模型，分别进行描述性分析、配对检验分析和二元Logistic回归分析。对事务所规模、审计费用变化、公司资产规模和资产负债率等因素与审计意见的关系进行了实证研究。通过理论分析和实证检验，文章得到如下结论：注册会计师能够揭露上市公司的会计舞弊行为，并出具非标准无保留审计意见。但依然有一部分上市公司的会计舞弊行为通过被出具带强调事项段的无保留意见进行粉饰。我国注册会计师的审计质量仍待提高。此外，论文还运用Logistic回归方法对审计意见影响因素进行实证分析。分析结果显示：事务所规模、上市公司的资产负债率和公司资产规模指标与非标审计意见显著相关，说明事务所规模等指标能够影响非标审计意见的出具；同时，注册会计师通过参考每期审计费用变化情况来分析上市公司的舞弊情况，有助于更加科学、合理的出具非标审计意见。最后，论文在前文研究的基础上提出要扩大事务所规模、规范注册会计师审计行业和加大监管力度等相关政策意见，以期降低审计风险，提高审计质量。本文的创新点主要体现在：本文专门研究已经发生会计舞弊并且被揭示的上市公司的审计意见类型及其影响因素，与当前国内外文献仅笼统地研究审计意见的影响因素相比更有针对性。