现代企业制度以“产权清晰、权责明确、政企分开、管理科学”为基本特征，公司治理和内部控制也已成为建立现代企业制度的核心。企业要增强竞争力、提高经营业绩，必须具有良好的公司治理结构和内部控制系统。此外，从微观层面上说，良好的公司治理结构和内部控制系统是保护企业所有者、企业其他利益相关者利益的要求，并且有利于保证现代市场经济秩序的有序性。公司治理结构和内部控制是两个不同的研究领域，但二者又具有密切相关的联系。公司治理结构是内部控制系统能够有效发挥作用的基础和前提。正是基于这一点，本文提出了论述的主要观点：公司治理结构直接影响到上市公司内部控制有效性。　　 按照论述的逻辑顺序，本文主要包括以下内容：综合评述国内外学术界关于公司治理结构和内部控制有效性研究的相关文献；阐述公司治理结构与内部控制有效性的概念并明晰各自内涵，介绍相关的基本理论，从理论上分析公司治理结构对内部控制有效性是否有影响、如何影响；选取样本数据，用实证研究的方法研究公司治理结构对内部控制有效性的影响，本文在公司治理结构方面共设置9个自变量，分别为实际控制人性质、第一大股东持股比例(％)、年度股东大会出席股份比例(％)、董事会规模、监事会规模、年度内董事会会议次数、年度内监事会会议次数、审计委员会设立情况和董事长兼任总经理情况。本文的研究分析是以2007-2009年国内所有发行A股的上市公司为样本，运用了回归分析的方法对内部控制有效性影响因素进行分析。最后，从完善公司治理结构的角度出发，本文依据实证研究的结果为我国上市公司提高内部控制有效性提出了几点建议。