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目的基于GTEx、TCGA、GEO等公共数据库明确MALAT1基因在胃癌中的表达情况,探讨MALAT1在胃癌中的临床意义,并探索干扰其表达水平后对胃癌细胞株BGC-823的增殖、侵袭、迁移及EMT进程的影响。方法基于TCGA及GTEx数据库探索MALAT1在206例正常胃黏膜组织样本和375例胃癌组织样本中的表达差异,明确胃癌组织中MALAT1的表达水平与患者临床病例资料的关系。筛选差异基因并进行GO分析及KEGG富集分析。应用MEM数据库筛选MALAT1共表达基因,并对其进行GO分析及KEGG富集分析。应用GEO数据库及Kaplan-Meier Plotter在线分析工具分析MALAT1的表达水平与胃癌患者OS的关系。应用RT-PCR技术检测人胃癌细胞株MGC80-3、HGC-27、SGC-7901、BGC-823及人胃黏膜上皮细胞株GES-1的MALAT1表达水平。将人胃癌BGC-823细胞分为si-MALAT1组和阴性对照组即si-NC组。同时构建MALAT1 siRNA和阴性对照siRNA,分别转染至两组BGC-823细胞中,干扰MALAT1基因的表达。应用RT-PCR技术明确MALAT1被siRNA干扰成功后,通过CCK-8实验、Transwell实验对比两组细胞成功转染siRNA后的增殖能力、迁移能力和侵袭能力。应用免疫印迹实验检测两组细胞成功转染siRNA后EMT标志性蛋白分子N-钙黏蛋白、E-钙黏蛋白、波形蛋白的表达水平。结果(1)基于GTEx数据库,在正常男性中,MALAT1的表达水平从高至低排序,前5位的器官为甲状腺(value=9.20)、垂体(value=8.72)、前列腺(value=8.70)、神经组织(value=8.50)、膀胱(value=8.25);从低至高排序,前5位的器官为肝脏(value=5.32)、胰腺(value=6.61)、骨骼肌(value=6.69)、胃(value=6.80)、脑(value=6.81)。在正常女性中,MALAT1的表达水平从高至低排序,前5位的器官为甲状腺(value=9.19)、卵巢(value=9.12)、垂体(value=8.81)、输卵管(value=8.72)、神经组织(value=8.51);从低至高排序,前5位的器官为肝脏(value=5.72)、胰腺(value=6.51)、骨髓组织(value=6.60)、胃(value=6.85)、骨骼肌(value=6.86)。(2)基于GTEx和TCGA数据库,共有206例正常胃黏膜组织样本,375例胃癌组织样本,共发现2144个差异基因,包含951个上调基因和1193个下调基因(P<0.05)。(3)基于TCGA及GTEx数据库,MALAT1在胃癌组织中的表达量显著升高,差异具有统计学意义(P<0.05)。TCGA数据库中,共有32对胃癌组织和癌旁正常胃黏膜组织,胃癌组织中MALAT1的表达水平与其配对的癌旁组织样本相比未见明显差异,差异无统计学意义(P>0.05)。(4)基于TCGA数据库,MALAT1的表达水平与胃癌患者的种族相关,不同种族患者MALAT1的表达水平不同,差异具有统计学意义(P<0.05)。其中亚裔人种中MALAT1的表达水平显著高于白种人、黑种人,差异具有统计学意义(P<0.05)。MALAT1的表达水平与胃癌患者的T分期具有相关性,不同T分期胃癌患者的MALAT1表达水平不同,差异具有统计学意义(P<0.05)。其中T3、T4期胃癌患者的MALAT1表达水平显著高于T1、T2期患者,差异具有统计学意义(P<0.05)。MALAT1在不同临床病理分期的胃癌患者中表达水平不同,差异具有统计学意义(P<0.05)。Ⅰ期患者与Ⅲ、Ⅳ期患者相比MALAT1的表达水平升高,差异具有统计学意义(P<0.05)。(5)对2144个差异基因进行GO分析结果显示,差异基因主要富集于补体激活经典途径、循环免疫球蛋白介导的体液免疫应答、Fc受体介导的刺激信号通路等基因功能。KEGG信号通路分析差异基因主要富集于细胞周期、ECM-受体相互作用、p53信号通路等信号通路(P<0.05)。MALAT1未能得到显著富集。(6)基于MEM数据库,对MALAT1共表达基因进行GO分析提示其主要发挥RNA剪接、细胞核的构成、Poly(A)RNA结合、蛋白质结合等基因功能。KEGG信号通路分析提示共表达基因可参与调控干细胞多能性的信号通路、mTOR信号通路、Fox0信号通路等信号通路(P<0.05)。(7)基于Kplan-Meier Plotter Gastric Cancer和GEO数据库,MALAT1高表达的胃癌患者(Cutoff>11770)较低表达(Cutoff≤11770)患者总生存期显著降低(P<0.05)。(8)MALAT1在MGC80-3、HGC-27、SGC-7901、BGC-823各胃癌细胞株中的相对表达量分别为1.48±0.07、2.00±0.26、3.48±0.50、4.18±0.20,均高于正常胃黏膜细胞株GES-1(P<0.05)。(9)si-MALAT1组较si-NC组的细胞增殖、侵袭和迁移能力均显著降低(P<0.05),EMT标志性分子波形蛋白、N-钙黏蛋白表达降低,E-钙黏蛋白的表达升高,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论(1)MALAT1在胃癌组织中显著高表达,且与患者的种族、T分期、临床病理分期及不良预后显著相关。人体中,MALAT1可能与RNA剪接、细胞核的构成、Poly(A)RNA结合、蛋白质结合、调控干细胞多能性的信号通路、mTOR信号通路、Fox0信号通路等基因功能和信号通路相关。(2)干扰MALAT1的表达水平,可抑制胃癌细胞BGC-823的增殖、侵袭、迁移及EMT进程。(3)MALAT1可能成为胃癌诊断、治疗及评估预后的潜在分子标志物及治疗靶点。