基于全外显子组测序的辽宁汉族成年人颅骨正常形态的关联基因筛选

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目的本研究通过采集辽宁汉族成年人颅骨CT数据和血液,获取其颅骨形态数据和基因型数据,将形态数据和基因型数据关联分析后,得到变异的SNP位点。再通过Sanger测序对变异位点进行检测,筛选与颅骨正常形态关联的基因,探讨辽宁汉族成年人颅骨形态,为以后颅骨形态的研究提供理论依据。方法采集50例受试者颅骨CT数据进行颅骨三维重建,经几何形态测量法获取颅骨形态数据,并采集其2ml血液提取DNA,运用全外显子组测序技术获取受试者基因型数据,构建混合线性模型计算形态与基因位点的关联性,得到变异SNP位点,筛选出候选基因。通过Sanger测序对变异位点进行SNP检测,最终得出影响颅骨正常形态的关联基因。结果1.颅骨形态数据与基因型数据关联分析结果显示:4个SNP位点与辽宁汉族成年人颅骨正常形态具有显著关联性(P<1×10-6),分别是的rs62152530、rs647711、rs1048603及rs838543,rs62152530和rs647711对应的候选基因分别为RGPD3、IGSF3,rs1048603及rs838543对应的候选基因为USP40。2.Sanger测序结果显示:rs62152530位点发生碱基突变的有50例,rs647711位点发生碱基突变的14例,rs1048603位点发生碱基突变的有11例,rs838543位点发生碱基突变的有10例。结论1.rs62152530、rs647711、rs1048603及rs838543这4个SNP位点与辽宁汉族成年人颅骨正常形态关联,候选基因为RGPD3、IGSF3、USP40。2.RGPD3、IGSF3、USP40与辽宁汉族成年人颅骨正常形态具有密切关系,RGPD3与左颌额点左眶额颧点之间的欧式距离相关,IGSF3与左右下颌角点之间的欧式距离(即下颌角间宽)相关,USP40与左右鼻额点之间的欧式距离(即鼻骨最小宽)相关。
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