本研究采用了T-RFLP技术和DGGE技术等分子生物学方法调查并比较了青县、昌邑、瓦房店三个再植障碍较严重的采样点土壤中的细菌多样性及群落结构,并结合相关环境数据,通过PCA、CCA等统计学方法评价了土壤中细菌群落变化与营养元素变化的相关性;同时对来自于环渤海湾苹果产区的九个采样点的土壤样品中的可培养细菌进行分离,获得了一株对苹果常见土传病害具有良好抗性的拮抗菌,以及能够有效降解苹果主要自毒物质——根皮苷的降解菌。多样性分析的结果表明,环渤海湾苹果产区的再植障碍园样品的群落结构特点与丰产园样品有明显差异;丰产园土壤中细菌群落的多样性以及均匀度指数大于再植障碍园样品,优势度指数则相反。CCA分析的结果表明土壤中Cu含量的变化与环渤海湾苹果产区再植障碍园与丰产园土壤中细菌群落结构的差异有一定的相关性。基于T-RFLP的定性分析的结果表明环渤海湾苹果产区果园土壤中占优势的细菌群落可能由Firmicutes、γ-Proteobacteria、Actinobacteria、α-proteobacteria、β-proteobacteria、Bacteroidetes和Tenericutes构成;再植障碍园土壤中γ-Proteobacteria和Actinobacteria所占比例大于丰产园;Tenericutes仅存在于丰产园样品中,仅存在于再植障碍园样品中的T-RF 489bp属于γ-Proteobacteria。DGGE分析的结果表明,环渤海湾苹果产区再植障碍园与丰产园土壤主要菌群属于Firmicutes、γ-Proteobacteria、Actinobacteria、α-proteobacteria。筛选获得了一株对苹果常见土传病害菌层出镰刀菌、串珠镰刀菌有明显抗性的拮抗菌,和一株能够明显降低土壤中根皮苷含量的降解菌。降解菌的盆栽效果已经得到验证,拮抗菌的实际生产效果还需检验。实验结果表明,环渤海湾苹果产区再植障碍园与丰产园土壤细菌群落结构存在明显差异,Tenericutes、Actinobacteria和γ-Proteobacteria这三种门类的细菌数量及所占比例变化是导致差异性的原因之一,且其中Tenericutes和γ-Proteobacteria的数量变化与土壤中Cu的含量具有一定的相关性。筛选获得的根皮苷降解菌可以有效的降低根皮苷对苹果的自毒作用。