KIT、RAB27A和MITF基因SNPs与鹅羽色性状关联性研究

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羽毛颜色是家禽品种(系)的重要特征,它与经济用途以及生产性能有直接或者间接的联系。为进一步筛选鹅羽色性状相关分子标记,本论文以四川白鹅与朗德鹅杂交F1世代鹅为研究对象,将其羽色表型按不同部位划分为三个不同类型,采用候选基因Sanger测序的方法,针对黑色素相关基因KIT、RAB27A、MITF部分外显子片段进行SNPs位点扫描以及羽色性状的关联性分析,为鹅的羽色遗传研究和育种实践提供参考依据。主要研究结果如下:1.在鹅KIT基因中发现4个SNPs位点,其中exon19上有1个(c.2526C>G),其突变导致氨基酸的改变(Ser839Cys),exon22上有3个(c.3311C>T,c.3507A>G,c.3544T>C)。位于exon19的c.2526C>G位点与鹅整体羽色表型极显著相关(P<0.01);c.3311C>T位点与鹅整体羽色中的白羽和花斑羽相对性状极显著相关(P<0.01);c.3507A>G与鹅整体羽色中的灰羽和白羽相对性状极显著相关(P<0.01),与翼部羽区的黑色素扩散缺陷相对性状、胸部白条带是否完整相对性状显著相关(P<0.05);c.3544T>C位点与鹅整体羽色表型极显著相关(P<0.01),与翼部羽区的黑色素扩散缺陷相对性状显著相关(P<0.05)。通过对KIT基因的SNPs进行单倍型分析,共得到7种单倍型和14种单倍型组合,其中的优势单倍型和优势单倍型组合分别为K2(CCAT)和K2K2。关联性分析表明,各单倍型组合与鹅整体羽色表型极显著相关(P<0.01),与胸部白条带的完整与否相对性状显著相关(P<0.05)。2.在鹅RAB27A基因的exon7上发现3个SNPs位点(c.2653C>A,c.2795G>A,c.2903A>G),均位于3’-UTR。其中,c.2653C>A和c.2903A>G位点与鹅整体羽色的白羽和花斑羽相对性状都极显著相关(P<0.01),与胸部白条带中的宽条带与窄条带相对性状都极显著相关(P<0.01);c.2795G>A位点未发现与羽色性状的显著关联性。通过对RAB27A基因的SNPs进行单倍型分析,共得到3种单倍型和3种单倍型组合,其中的优势单倍型和优势单倍型组合分别为R1(CGA)和R1R1。关联性分析表明,各单倍型组合与鹅整体羽色的白羽和花斑羽相对性状、胸部白条带的宽条带与窄条带相对性状显著相关(P<0.05)。3.在鹅MITF基因的exon10上发现3个SNPs位点(c.1313C>T,c.1466C>T,c.1679A>G),均未发生氨基酸的改变。其中,c.1313C>T位点与翼部羽区的灰白羽和全灰羽相对性状极显著相关(P<0.01),与翼部羽区的单边和双边灰白相间羽相对性性状显著相关(P<0.05);c.1466C>T位点与鹅整体羽色表型、翼部羽区灰白羽和全灰羽相对性状都极显著相关(P<0.01);c.1679A>G位点与鹅整体羽色的灰羽和白羽相对性状极显著相关(P<0.01)。通过对MITF基因的SNPs进行单倍型分析,共得到7种单倍型和13种单倍型组合,其中的优势单倍型和优势单倍型组合分别为M2(CCG)和M1M2。关联性分析表明,各单倍型组合与鹅翼部羽区表型极显著相关(P<0.01)。综上所述:KIT、RAB27A、MITF基因与鹅的羽色相关,在羽色的调控中发挥重要的作用。具体来说,MITF基因对鹅翼部羽区羽色性状调控发挥主要作用,RAB27A基因对鹅胸部白条带羽色性状调控发挥主要作用。此外,KIT基因对鹅翼部羽区和胸部白条带羽色性状调控也发挥着一定的作用。这三个基因可能存在基因互作,需要进一步深入探析形成机制,以期为鹅的羽色遗传和选育提供理论依据。
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