建立现代企业制度是企业走向市场的制度要求。水利工程勘察设计单位多年来一直在计划经济体制下沿用事业单位的体制，存在着思想观念陈旧、管理机制不活、人员结构失衡等诸多弊端问题。这些问题已成为一个亟待解决的改革难点，必将成为企业在社会主义市场经济运行中的一个障碍。 本文从青海黄河水利水电设计公司的实际出发，运用现代企业制度的基本理论和系统工程的分析方法，通过统计数据和历史资料，对影响企业改制的几种重要因素做了分析和阐述；探讨了国有勘察设计单位在体制改革中面临的各类问题，指出了研究对象的产业发展现状和存在的问题；应用内外部环境SWOT分析法，对外部环境运用ETOP、分析了青海黄河水利水电设计公司改制的环境条件；通过GE矩阵法以及ISM技术分析论证，应用层次分析(AHP)法、模糊综合评价法对产业战略方案进行了评价，分析论证了黄河水利水电设计公司的改制方案；提出企业改制的基础是建立一个比较科学和规范的现代企业制度，并尝试通过产权改革，股份制改造，完善组织形式，建立股权激励机制，强化企业内部劳动制度、用工制度、分配制度的改革等措施，建立现代科技型工程勘察设计资质管理的运行机制，逐步建立“产权明晰，权责分明、政企分开、管理科学”的现代企业制度和完善的法人治理结构，为企业的健康发展确立良好的体制保障。本文得出结论，建立现代企业制度是增强国有设计单位活力，增强其竞争力的必然之路和最有效的途径，选择一个符合公司发展要求的、先进合理的运作机制是至关重要，通过改制，实现产权清晰、权责明确和政企分开，企业的法律独立人格得到维护。