基于新一代测序技术的梅毒患者tprK基因多样性分析

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背景:梅毒螺旋体的重复基因K(tprK)被认为在梅毒持续性感染过程中扮演重要的角色。早期对于tprK基因多样性的研究以兔传的菌株为研究对,很少关注梅毒患者体内的变化特点,且采用的是菌落克隆-Sanger测序。方法:收集28份厦门大学附属中山医院就医的一期和二期梅毒患者的皮损标本,采用新一代测序技术(NGS)探讨梅毒患者tprK基因的变化特点。结果:不论在一期或者二期梅毒患者体内,梅毒螺旋体tprK基因的七个可变区均存在不同序列的混合。在计算每个可变区内不同序列所占比例时,发现除了可以用先前的克隆-S
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