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棉花是世界上重要的天然纤维作物,同时也富含蛋白质和油脂。棉属共含有52个棉种,其中栽培种4个,野生种48个。栽培种中陆地棉的栽培面积最大,且产量在世界棉花总产量中达到95%以上,陆地棉因遗传基础相对狭窄,想要更好的改良陆地棉的性状必须扩大其遗传资源。野生棉因长期接受自然选择,在盐碱、干旱、贫瘠、病虫等环境下繁衍生存,所以自然形成了有关这方面的遗传优势,遗传基础相对丰富。毛棉是四倍体野生棉的一种,首次发现是在美国的夏威夷群岛,具有多绒毛、无蜜腺、抗旱、抗盐碱、抗病虫和纤维强度高等特点,毛棉是四倍体棉种,可以和陆地棉杂交获得可遗传后代,故可作为丰富和改良陆地棉农艺性状的材料。本次研究以陆地棉CCRI 35与毛棉P0601211为亲本,建立BC1后代作为作图群体,来构建陆地棉和毛棉的种间遗传连锁图谱。研究结果如下:1.SSR引物多态性的筛选本次实验用4536对SSR引物对亲本CCRI 35、P0601211进行多态性筛选,共获得968对多态性引物,多态性比例达21.34%。2.BC1群体标记基因型的检测利用CCRI 35、P0601211杂交得到F1代,F1再与CCRI 35回交获得BC1群体。从BC1群体中随机编号92个单株,利用上述获得的968对多态性引物对该92个单株进行多态性位点的检测。共获得1023个标记位点,其中55对引物为双位点标记引物。通过卡方检测,其中偏离孟德尔遗传分离比的标记位点为119个,偏分离比例达11.63%3.陆地棉和毛棉的种间遗传连锁图谱构建利用JoinMap对上述获得的1023个多态性标记位点进行遗传连锁分析,构建陆地棉与毛棉的种间遗传连锁图谱,遗传图谱含28个连锁群,1021个标记位点,覆盖长度4110.7 cM,标记间平均距离为4.0 cM。其中A亚组染色体含521个标记位点,覆盖长度2079.2 cM,标记间平均距离为4.0 cM,D亚组染色体含500个标记位点,覆盖长度2031.5 cM,标记间平均距离为4.1 cM。4.遗传连锁图谱与陆地棉、雷蒙德氏棉物理图谱间的共线性分析利用构建好的陆地棉与毛棉的种间遗传连锁图谱分别与陆地棉、雷蒙德氏棉的物理图谱进行共线性比较分析,显示大部分标记位点与物理图谱的基因组序列共线性良好。26条染色体上的1021个标记位点中有880个标记位点在陆地棉基因组上找到对应位置,共覆盖陆地棉基因组的95.4%。在A亚基因组中,2079.2 cM对应到1.29 GB,覆盖跨度为96.0%。在D亚基因组中,2031.5 cM对应到783 MB,覆盖跨度为94.4%。