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背景:乙肝病毒感染在全球范围内都是一个严重的公众健康问题,尤其是在中国汉族人群中。在我们过去的研究中已经证实,可诱导共刺激因子(ICOS)的基因多态性与慢性乙肝病毒感染有关。乙肝病毒感染结局同时受病毒学的、免疫学的和宿主基因的因素影响。同时,过去的研究已经证实乙肝病毒突变对乙肝病毒感染后的结局有影响。这个研究的目的在于,进一步探索ICOS单核苷酸多态性在HBV不同亚型感染中的影响及其与病毒突变共同作用对HBV感染结局的影响。方法:我们一共招募了1636个中国汉族人参与研究,其中包括:47个无症状的乙肝病毒携带者、353个慢性乙型病毒性肝炎病人、327个乙肝相关的肝硬化病人、193个乙肝相关的肝癌病人、464个自限性清除者和252正常的对照者。我们通过Taq Man SNP基因分型检测与分析工具检测上述参与者的DNA样本中的ICOS基因的4个位点(rs11883722、rs10932029、rs1559931和rs4675379)。我们用直接测序法确定HBV在核心启动子区(Enh II/BCP/PC)的突变。在校正年龄和性别因素的情况下,采用二元逻辑回归分析单核苷酸多态性及HBV突变的共同作用。结果:我们发现在C型HBV感染中,ICOS的rs10932029位点TC基因型与降低乙肝相关的肝硬化风险有相关性(P=0.003,OR=0.261)。在C型HBV感染中,核心启动子区A1762T(P=0.000,OR=4.784)、G1764A(P=0.019,OR=4.035)、A1762T/G1764A双突变(P=0.000,OR=9.133)对于增加肝硬化的风险有显著影响。进一步的研究表明,rs10932029位点TC基因型分别与A1762T(P=0.014,OR=0.144)或A1762T/G1764A双突变(P=0.014,OR=0.123)同时作用仅仅在C型HBV感染中明显降低肝硬化的风险。然而,rs10932029位点TC基因型与G1764A共同作用与肝硬化的发生无明显的相关性。结论:在C型HBV感染中,rs10932029位点TC基因型可能是一个肝硬化的保护因素。Rs10932029位点TC基因型与A1762T单突变或者A1762T/G1764A双突变的共同作用,均能降低肝硬化的风险。