叶尔羌汗国时期是伊斯兰教在新疆广泛传播的重要阶段,伊斯兰教日益深刻的渗透到新疆的社会政治、经济、文化及生活的各个方面。与此同时,一股新的伊斯兰教贵族势力——和卓势力不断发展壮大,它与伊斯兰教的传播发展相互依托,对伊斯兰教在新疆的发展产生了深远影响。分析研究叶尔羌汗国时期和卓势力与伊斯兰教发展的关系,进而揭示和卓势力对伊斯兰教发展的影响,对于进一步了解把握叶尔羌汗国时期及后世伊斯兰教发展与世俗政治的关系具有重要意义。通过对叶尔羌汗国时期伊斯兰教发展的历史考察,我们不难发现和卓势力最先以一种宗教势力的面目出现的,继而发展成为一股强大的政治势力。伴随和卓势力的崛起,伊斯兰教神秘主义——苏非主义开始蔓延开来,苏非派日渐成为新疆伊斯兰教举足轻重的势力。和卓势力借助伊斯兰教苏非神秘主义的力量迅速崛起,不断攫取汗国的统治权,并通过其获得的宗教政治特权使苏非派在新疆伊斯兰教中居于支配地位,进一步确立苏非派在新疆伊斯兰教中的崇高地位。苏非主义大行其道,叶尔羌汗国时期伊斯兰教发展明显融入了神秘主义的因素,出现了宗教势力与世俗政治趋于合流的倾向,和卓势力即其体现者。这样,就使得伊斯兰教的发展出现了新的变化,包括教义的丰富,教派势力的重新划分,神秘主义的流行,麻扎朝拜盛行,和卓地位神圣化的确立等等,都标志着伊斯兰教的发展进入了一个新阶段,而所有这些归根结底则是由于和卓势力的发展所造成。应该说,和卓势力与苏非主义的关系是叶尔羌汗国时期乃至后世新疆伊斯兰教发展的一条重要脉络,它们在推进新疆伊斯兰化过程中扮演了重要角色。和卓势力与苏非派相互勾结利用,力图实现政教合一的主张,对后世新疆政治与伊斯兰教发展都产生了深远影响。