经济体制改革以来,农村的卫生情况令人担忧。在健康保障机制缺失下的高额治疗费用障碍,导致疾病的经济风险增大,而疾病风险使没有健康保障的农民的医疗问题陷入脆弱性。本研究旨在社会资本的视角下探讨新型农村合作医疗系统,研究出能对农民健康保障制度起到促进作用,并能推动新型农村合作医疗健康、可持续发展的影响因素。本文主要研究农民参加新农合意愿的非经济影响因素。首先,运用社会资本理论,分析了社会资本与新型农村合作医疗系统的关系。分析表明,从患病概率和看病成本看,农民有参加新型农村合作医疗的客观要求,而作为一种自愿性的公立医疗保险计划,影响农民参加新农合的关键因素不再是支付能力,而是参与意愿。然后,构建了社会资本视角下的新型农村合作医疗系统模型,并运用元胞自动机模拟了基于农民参与行为下的新农合医疗系统。模拟实验表明,随着社会资本影响因子的增大,系统中参与人数不断增加;但当社会资本提升到一定程度后,社会资本对提高参与率的作用不太明显。这就说明,社会资本是影响农民参与新型农村合作医疗的重要因素,在其他因素不变的情况下,可以通过提高农民的社会资本来提高农民参与率。CA模型的仿真模拟验证了本文的方法和构建的模型是有效的,该系统模型可为相关政策部门提供有价值的政策建议。