中国钮襀亚科分子系统学及两种襀翅虫的线粒体基因组分析

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钮襀亚科(Acroneuriinae)隶属于襀翅目(Plecoptera)、北襀亚目(Arctoperlaria)、原颚类(Systellognatha)、襀科(Perlidae)。长期以来,钮襀亚科属级分类阶元的划分较为混乱,各属之间的系统发育关系不清,为了更好的弄清楚钮襀亚科属级阶元的划分界限以及系统发育关系,本文对钮襀亚科4属、30个样本的cox1基因和18SrDNA基因片段进行了扩增,分别计算了样本之间的遗传距离,并使用NJ法、ML法、BI法对cox1基因数据集、18SrDNA基因数据集以及cox1与18SrDNA联合基因的数据集分别进行了系统发育分析,其结果可为深入开展钮襀亚科的分子系统学研究提供基础数据;同时,本文还对黄色黄襀Flavoperla biocellata(Chu)和背突卷襀Leuctrafusca(L.)的线粒体全基因组进行了测序和分析,并结合Genbank上的襀翅目昆虫线粒体全基因组数据,用PCG13数据集以及PCG13+rRNA数据集进行了襀翅目的系统发育分析。本文主要研究结果如下:1.基于cox1基因,采用NJ法、ML法和BI法构建系统发育树,3种建树方法构建的系统发育树结果均不能支持华钮襀属、黄襀属、梵襀属和扣襀属的单系性;基于18SrDNA基因,采用NJ法、ML法和BI法构建系统发育树,3种建树方法构建的系统发育树结果均支持梵襀属的单系性,而华钮襀属、黄襀属、扣襀属的单系性均得不到支持;基于cox1与18SrDNA联合基因,采用NJ法、ML法和BI法构建系统发育树,3种建树方法构建的系统发育树结果均不能支持华钮襀属、黄襀属、梵襀属和扣襀属的单系性。2.黄色黄襀F biocellata线粒体全基因组的全长为15,805 bp,整个线粒体基因组的A+T含量为67.2%,PCGs的A+T含量为66.4%,tRNA基因平均A+T含量为70.4%,rRNA基因A+T含量为70.6%,一共包含37个基因,其中有11个蛋白质编码基因以ATN作为起始密码子,但是nad5基因以GTG作为起始密码子,nad1以TTG作为起始密码子;11个蛋白质编码基因具有完整的终止密码子,但是cox1基因和cox2基因存在不完整的终止密码子T。此外,trnSer(AGN)的DHU臂缺失形成一个小环,其余tRNA的二级结构都是典型的三叶草形状。3.背突卷襀L.fusca线粒体全基因组全长14,585bp,整个线粒体基因组的A+T含量为66.1%,PCGs的A+T含量为65.0%,tRNA基因的A+T含量为68.9%,rRNA基因A+T含量为70.6%,一共包含37个基因,其中有11个蛋白质编码基因以ATN作为起始密码子,但是nad1和atp6基因分别以TTG和GTG作为起始密码子,有10个蛋白编码基因具有完整的终止密码子,但是cox1、cox2以及nad5基因中存在不完整的终止密码子T。此外,trnSer(AGN)的DHU臂缺失形成一个小环,其余tRNA的二级结构都是典型的三叶草形状。4.本文采用用了 PCG13、PCG13+rRNA两种数据集,以贝叶斯法(BI)和最大似然法(ML)两种建树方法进行系统发育分析,其结果都能将南襀亚目和北襀亚目区分开来,即支持南襀亚目和北襀亚目的单系性;并且支持真颚类叉襀总科的单系性;原颚类襀总科和大襀总科的单系性,但是,去掉Flavoperla biocellata的PCG13+rRNA数据集或Leuctra fusca PCG13+rRNA数据集建立的ML树,结果显示襀总科和大襀总科呈并系。
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