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玉米是一种高产且多用途的作物，在国民经济中具有重要的地位。它也是山西省的主要农作物之一，其种植面积、单产水平和总产量均居省内各作物首位。山西省地形狭长，南北跨越6.3个纬度，东西只有4.2个经度。境内山峦起伏，海拔高差1800m左右。气候变化多样，生态类型复杂。玉米种植区大致分为：春播特早熟区、春播早熟区、春播中晚熟区和夏播中早熟区四大生态区。其中春播中晚熟区面积最大，单产最高，总产占全省玉米总产量的一半左右。所以，提高该区玉米遗传改良水平，促进玉米产量、质量的提升，对山西农业发展具有重要意义。种质资源是遗传改良的重要物质基础，是提高育种水平的关键所在。为此采用成熟的SSR分子标记技术，以国内6个自交系作为标准检测种，对山西省春播中晚熟玉米区的18个审定品种所涉及的32个自交系进行遗传多样性分析和杂种优势群划分的研究。其结果如下：（1）利用SSR分子标记技术对32份山西省中晚熟玉米区审定品种的自交系进行遗传多样性分析。结果表明，覆盖全基因组的40对SSR引物共检测出210个等位基因，每个SSR位点的等位基因数为2～11个，平均为5.2个；多态性信息量（PIC）变化范围在0.41～0.84之间，平均为0.67；标记索引系数（MI）变化范围在0.82～5.14之间，平均为2.49；等位基因有效系数（NE）变化范围在1.70～6.39之间，平均为3.42。反映了中晚熟玉米种植区自交系丰富的遗传多样性。（2）共检测出35个稀有等位基因，31个特有等位基因。在24个位点共检测出35个稀有等位基因，其中，在bnlg2331位点检测到稀有等位基因数最高（4个）。有19个位点有特有等位基因，共检测出31个特有等位基因，其中，mmc0191和phi126这2个位点，检测到特有等位基因数目高达4个。说明该区玉米自交系具有丰富的等位变异性。（3）计算出32个玉米自交系的遗传距离；通过UPGMA聚类分析法把32个自交系大体分成了4个大群：第Ⅰ类群分为3个亚群，第1亚群（BSSS种质）只有标准种质B73无供验材料；第2亚群（PA种质）包括6个材料；第3亚群（兰卡斯特种质）包括2个材料。第Ⅱ类群（旅大红骨种质）包括13个材料。第Ⅲ类群（PB种质）包括7个材料。第Ⅳ类群（唐四平头种质）包括4个材料。遗传距离平均为0.226，表明该群体自交系遗传基础比较狭窄，这是影响当前玉米遗传改良的主要问题。