MKK4基因启动子区多态性与结直肠癌发病的关联研究

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目的:通过病例-对照研究法试讨论丝裂原活化蛋白激酶激4(mitogen-activated protein kinase kinase4,MKK4)基因rs3826392和rs3809728两位点的单核苷酸多态性(single nucleotide ploymorphisms,SNP)与结直肠癌(Colorectal Cancer CRC)发病风险关联性,为CRC高危人群的筛选和早期诊断提供理论依据。方法:提取2012年2月-2013年2月间就诊于河北医科大学第四医院211例CRC患者(结肠癌68例,直肠癌143例)和132例健康人(对照组)外周静脉血5ml,采用蛋白酶K消化-饱和氯化钠盐析法提取研究对象白细胞中的DNA,同时记录病例的一般人口学特征、吸烟史、饮酒史及癌症家族史等信息。应用聚合酶链反应-连接酶特异检测技术(Polymerase ChainReaction-ligase detection reaction,PCR-LDR)分析CRC患者和对照组MKK4基因rs3826392T/G和rs3809728A/T位点多态性,比较不同等位基因及基因分型与CRC易感性的关系。应用SPSS13.0软件对实验数据进行统计处理,采用χ2对对照组基因型频率进行Hardy-Weinberg平衡分析,采用χ2检验及t检验对两组病例的一般情况进行统计分析,采用χ2检验对两组之间的基因型和等位基因型分布分别进行比较分析,采用EH软件和2LD软件对两组病例进行单体型频率和连锁不平衡分析。P<0.05为有统计学意义。应用非条件Logistic回归法计算表示相对风险度的比值比(odds ratio, OR)及95%可信区间(95%confidence interval, CI)。结果:1对照组中-1304T>G和-1044A>T两个位点的基因型频率分布都符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),即本实验研究对象的选择是随机的。2MKK4基因-1304T>G多态性与CRC发病风险的关联性MKK4基因-1304T>G位点上等位基因T和G在结肠癌组中出现频率为84.56和15.44%,直肠癌组中出现频率为82.87%和17.13%,在对照组中为71.59%和28.41%,结肠癌组和直肠癌组分别与对照组相比,差异均具统计学意义(P为0.004和0.002)。与T相比G降低了结肠癌和直肠癌的发病风险(OR=0.460,95%CI=0.269-0.787;OR=0.521,95%CI=0.347-0.783)。结肠癌组中TT、TG、GG三种基因型出现的频率分别72.06%、25.00%、2.94%,TG+GG出现频率为27.94%;直肠癌组TT、TG、GG基因型出现频率为67.83%、30.07%、2.10%,TG+GG为32.17%;对照组中为50.76%、41.67%,7.57%,TG+GG为49.24%;直肠癌组与对照组中TT基因型与TG、GG、TG+GG分别相比较,差异具有统计学意义(P分别为0.017、0.012、0.004);结肠癌组与对照组中TT与TG、GG、TG+GG相比,差异有统计学意义(P为0.009、0.158、0.004)。携带TG基因型的个体及TG+GG基因型总体的直肠癌的发病率明显降低(TGvsTT: OR=0.540,95%CI=0.326-0.896;GG vs TT:OR=0.207,95%CI=0.055-0.781;TG+GGvs TT:OR=0.489,95%CI=0.300-0.797)。3MKK4基因-1044A>T位点多态性与CRC发病风险的关联性MKK4基因1044A>T位点上等位基因A和T在结肠癌组、直肠癌组中出现频率为73.53%、26.47%、74.13%和25.87%,正常对照组中为78.03%和21.97%,结肠癌组和直肠癌组与对照组相比,差异无统计学意义(P为0.145和0.284);与A相比T与结肠癌和直肠癌的发病无相关性(OR=1.421,95%CI=0.876-2.305;OR=1.240,95%CI=0.836-1.838)。在结肠癌组中AA、AT、TT三种基因型出现的频率为:54.41%、38.24%、7.35%,直肠癌组中为:54.55%、38.24%、7.35%,对照组中为:61.36%、33.33%、5.31%。结肠癌组与对照组中AA基因型与AT、TT、AT+TT分别相比较,差异无统计学意义(P为0.416、0.467、0.344);直肠癌组与对照组中AA与AT、TT、AT+TT分别相比较,差异无统计学意义(P为0.276、0.583、0.253)。与AA基因型相比,携带AT、TT基因型的个体以及AT+TT基因型与结肠癌和直肠癌的发病率无相关性(ATvsAA:OR=1.564,95%CI=0.465-5.253;TTvsAA:OR=0.749,95%CI=0.266-2.110;AT+TT vs AA:OR=1.331,95%CI=0.736-2.405)。4MKK4rs3826392T/G和rs3809728A/T两SNP s位点联合分析直肠癌组和对照组中MKK4基因rs3826392T/G与rs3809728A/T两位点间存在连锁不平衡现象(D’=0.213)。rs3826392T-rs3809728T单体型(OR=0.531,95%CI=0.119~0.723)与直肠癌发病存在相关性,其余单体型与直肠癌的发病风险无关联性。rs3826392T/G与rs3809728A/T两位点间存在连锁不平衡现象(D’=0.993)。四种单体型与结肠癌的发病无关联性。结论:1MKK4基因-1304T>G SNP与CRC的发病风险存在相关性。携带TG基因型的个体以及TG+GG基因型总体的CRC的发病率明显降低;相比T等位基因G降低了CRC的发病风险。1044A>T SNP可能与CRC的发病风险无相关性。2在直肠癌和对照组中MKK4基因rs3826392T/G与rs3809728A/T两位点间存在连锁不平衡现象(D’=0.213)。rs3826392T-rs3809728T单体型(OR=0.531,95%CI=0.119~0.723)降低直肠癌发病风险,rs3826392T/G与rs3809728A/T交互作用与结肠癌的发病无明显相关性。
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