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体细胞核重编程不完全是造成体细胞核移植效率低的主要原因之一,而表观遗传修饰异常与重编程不完全密切相关。表观遗传修饰包括DNA甲基化和组蛋白修饰等,DNMT1维持DNA甲基化,表达异常会引起DNA甲基化水平的异常。MicroRNA(miRNA)是一类非编码小RNA,作用是降解靶基因或抑制靶基因的翻译。研究发现,高甲基化抑制miR-148a表达,DNMT1为miR-148a的靶基因,受miR-148a的调控。为进一步了解miR-148a与DNMT1在正常体细胞中是否存在相互作用关系,以及内源性miR-148a作为表观遗传修饰的调控因子在体细胞重编程过程中的作用与机制,本研究通过生物信息学和双荧光素酶检测方法在猪中验证了DNMT1是miR-148a的靶基因,及其相互作用关系,研究了过表达miR-148a对猪核移植胚胎发育的影响及其初步机理。研究取得如下主要结果: 1.miR-148生物信息学分析及miR-148a靶向调节DNMT1的功能验证 本研究利用软件预测了miR-148a的靶基因,双荧光素酶实验进行了靶基因验证。成熟序列比对发现,miR-148基因家族在第1至8位、11至19位高度保守,说明miR-148基因家族的高度保守性。进化树分析结果显示,miR-148基因家族主要分为哺乳动物miR-152、鱼类miR-152和miR-148a/b两支。靶基因GO和KEGG分析发现,miR-148a靶基因富集于基因表达、转录调控活性、胚胎发育、癌症信号通路等过程中。双荧光素酶实验结果显示,猪DNMT1为miR-148a的靶基因。 2.miR-148a与DNMT1相互调控的研究 本研究克隆分析了猪的miR-148a启动子序列,结果显示,2043bp启动子序列中存在高甲基化位点,含两个启动子区,转录因子以Sp1、AP2为主。将克隆片段与pGL-3-Basic载体连接,结果显示,与未转染组相比,转染pGL3-148a-0.6K、pGL3-148a-1K质粒组荧光素酶比值无显著变化(P>0.05),转染pGL3-148a-2K和pGL3-promoter质粒组荧光素酶比值显著增加(P<0.05),说明2043bp序列具有启动子活性。5ng/mL和10ng/mL bFGF处理共转染pGL3-148a-2K和pRL-TK的猪成纤维细胞,结果显示,bFGF处理组细胞的双荧光素酶表达水平显著下降(P<0.05)。5ng/mL和10ng/mLbFGF处理猪成纤维细胞,miR-148a的表达量逐渐下降,DNMT1表达逐渐增加,差异显著性(P<0.05)。0.5μM和1μM5-aza-dC处理猪成纤维细胞,miR-148a的表达量逐渐升高,DNMT1表达逐渐降低,差异显著(P<0.05)。 3.过表达miR-148a猪成纤维细胞系的建立及分析 本研究采用三质粒包装体系进行了高滴度慢病毒包装和感染,结果显示,miR-148a表达量提高了5倍,靶基因DNMT1表达显著降低(P<0.05),DNMT3a基因表达变化不显著(P>0.05);Western blot分析发现,过表达miR-148a组DNMT1蛋白表达水平显著降低(P<0.05)。细胞免疫荧光结果显示,过表达miR-148a组DNA甲基化水平显著降低(P<0.05)。过表达miR-148a后增殖受到抑制(P<0.05),G0/G1期细胞显著增加(p<0.05)。 4.过表达miR-148a对猪核移植胚胎发育及相关基因表达的影响 本研究分析了miR-148a在体外成熟猪卵母细胞、孤雌胚胎(PA)及SCNT中的表达,及过表达miR-148a对猪SCNT胚胎发育、DNA甲基化、组蛋白修饰、合子启动基因和多能性因子表达的影响。结果显示,miR-148a在体外成熟猪卵母细胞中低表达,在早期PA中先升高后降低。除囊胚期外,miR-148a在猪SCNT胚胎中的表达显著低于PA和IVF胚胎(P<0.05)。过表达miR-148a显著提高猪SCNT囊胚率(20.79%vs14.36%、14.9%,P<0.05)和囊胚细胞总数(39.15±6.36vs33.25±7.14、34.38±8.50,P<0.05)。过表达miR-148a,2-细胞和4-细胞期SCNT胚胎基因组DNA甲基化水平显著降低,2-细胞、4-细胞和囊胚期DNMT1表达亦显著降低(P<0.05),2-细胞和4-细胞期DNMT3a、TET1、TET3表达显著升高,2-细胞和囊胚期TET2表达亦显著升高(P<0.05)。此外,过表达miR-148a,2-细胞和4-细胞期H3K4me3表达显著提高(P<0.05),4-细胞和囊胚期H3K9me3表达显著降低(P<0.05),2-细胞期H3K9ac表达显著提高(P<0.05),2-细胞期HDAC1、HDAC2、KDM5A、HAT1表达显著提高(P<0.05),4-细胞期HDAC2表达显著降低(P<0.05),2-细胞和4-细胞期eIF3A和TFIIA、囊胚期Oct4、Nanog表达显著提高(P<0.05)。 以上结果表明,DNMT1是miR-148a的靶基因,两者之间存在相互调控的作用。过表达miR-148a可下调DNMT1基因的表达,上调重编程相关基因表达,提高猪核移植胚胎早期发育能力。