军用技术创新体系和民用技术创新体系(以下简称军民技术创新体系)是国家创新体系的两个重要组成部分。随着全球科技竞争日益加剧,技术创新的综合性与复杂性越来越高,军民技术创新体系协同已经成为应对创新环境变化,促进技术创新,实现创新资源共享,提升国家创新能力的有效途径。因此,积极推进军民技术创新体系协同建设,已经成为我国国家创新体系建设的重要内容。论文选择军民技术创新体系协同模式问题作为研究内容,进行了探索性的研究工作。论文在国内外技术创新和军民融合的相关研究基础上,运用协同学、系统理论和经济学理论,采用实证分析与理论分析相结合的研究方法,对军民技术创新体系协同的特征,协同模式的设计与分析,影响因素及不同协同模式的差异性,运行效果等问题进行了系统的研究。论文主要结论和观点包括：军民技术创新体系协同的模式可以分为组织内部协同模式和跨组织边界的外部协同模式两种。通过博弈模型分析,表明两种协同模式的经济效率明显不同,内部协同模式的经济效率和投入成本要优于外部协同模式；特别是技术溢出效应明显,且技术溢出能够带来显著的协同效应的情况下,前者的优势更明显。但在实践中,军民技术创新体系外部协同模式是广泛存在的。资源、环境与组织因素对军民技术创新体系协同运行具有积极的影响,其中,环境因素是最显著相关的影响因素。资源因素中资源共享能力对创新成果、创新效益和创新管理都有显著正向相关性,而存量技术的扩散能力与创新成果和创新效益有显著正向相关性,但与创新管理没有显著的相关性；最重要的环境因素中,市场要素、政府要素对军民技术创新体系协同都有正向显著相关影响,中介平台建设对创新成果和创新效益的影响显著,但与创新管理的作用不显著；组织因素中,组织结构、人才机制和信息管理与技术创新体系协同运行效果都有显著的影响关系,但信息管理对创新效益的影响不显著。结合影响因素的研究结论,对内部协同模式和外部协同模式的差异性进行了比较,在三个影响因素的八个指标中,除了组织结构以外的指标,都对开展内部协同模式更加有利,影响因素的分析结果表明内部协同模式的协同效应更容易实现,也更有效率。从创新水平与效果、创新效益、运行管理三个维度构建了军民技术创新体系协同运行的效果评估指标体系,采用层次分析法为评价指标设置权重,运用逼近最优解(TOPSIS)法对协同运行效果进行评价。运用构建的评价模型对五家实施军民技术创新体系内部协同的组织的运行效果进行实证研究,进一步验证了评价模型。运用研究结论,讨论并提出了我国军民技术创新体系协同运行的对策和建议,包括政府加强军民技术创新体系协同的顶层设计、完善军品市场开放机制、资源共享和信息交流平台建设、技术创新管理机制建设和实施军工企业集团化建设战略等五个方面。