嘉陵江流经重庆主城区,汇入长江,并承接主城区众多污废水及上游来水,担任主要供水水源,该水域的水质情况体现了嘉陵江上游及重庆主城的水体污染状况,并对长江重庆段水环境质量产生重要影响;三峡库区成库后,重庆下游段属于湖泊型水体,水体流速慢,接纳沿江两岸大量污水和上游来水,而且是主要供水水源,该水域的水质情况反映了三峡库区重庆上游段水体污染状况,并对三峡库区水环境及生态产生重要影响。本论文就两大方面展开了研究:一方面是关于嘉陵江重庆主城江段,1、周年内嘉陵江重庆主城江段所有浮游藻类及其优势种的种类、数量,2、统计出春季该流域浮游藻类种类组成、分布及数量,3、找出调查水域影响浮游藻类种类组成、分布及数量的相关因子,4、找出调查水域浮游藻类随各影响因子的变化规律,并对水质状况作出生态学评价。研究结果表明,嘉陵江重庆主城江段2006年4 -5月春季共检测出浮游藻类7门,50属,88种。各种藻类组成比例由高到低分别为绿藻43.5%,硅藻31.8%,蓝藻12.9%,裸藻2.4%,甲藻和金藻各1.2%。该江段没有形成单一的优势种群,优势种类主要有硅藻类的直链藻和小环藻,绿藻类的小球藻,蓝藻只在4月的一个采样点作为优势种出现。2006年4月到2007年1月浮游藻类以硅藻和绿藻为主,蓝藻次之,黄藻、金藻和裸藻偶尔出现。硅藻在各个季节都占优势(9月除外),并且在1月份所占优势最为明显,达到了4.69万个/L;9月份绿藻和硅藻共同占优势,数量分别达到2.803万个/L;2.765万个/L。总体来说浮游植物数量的季节变化曲线呈单峰型,9月份达到高峰。评价结果显示,嘉陵江重庆主城段水体营养充足,但主要受水文和气候条件影响,藻类数量并没有明显变化,水体受到有机污染严重,春、冬季水质较夏、秋季差。另一方面是关于三峡库区重庆下游段,1、春季三峡库区重庆下游段浮游藻类种类组成、分布及数量,2、找出调查水域浮游藻类优势种随各影响因子的变化规律,并对水质状况作出生态学评价。研究结果表明,三峡库区重庆下游段万州到巴东干流段2007年3月23日-3月27日检测到藻类4门11属11种。各种藻类组成比例高低分别为硅藻45.45%,绿藻36.36%,甲藻9.09%,裸藻9.09%。各采样点均有美丽星杆藻,颗粒直链藻,针杆藻和克洛脆杆藻的出现。整个调查区域库区干流万州、云阳、巫山和巴东浮游藻类数量分别为1.49×10~4cells/L, 2.59×10~4cells/L, 0.645×10~4cells/L, 0.815×10~4cells/L。支流小江、老云阳城、汤溪河、大宁河浮游藻类数量分别为3.52×10~4cells/L, 3.00×10~4cells/L, 3.01×10~4cells/L, 0.08cells/L。除了支流大宁河,支流浮游藻类数量比干流高。根据相关性分析表明,库区干流和支流浮游藻类数量与叶绿素a均不呈显著相关性,库区干流浮游藻类数量与理化指标也不呈显著相关性,但支流浮游藻类数量与理化指标呈一定的显著相关性。评价结果显示,在春季三四月份库区干流和支流水质污染均较严重,支流污染更为严重,可能暴发水华。