普洱茶大叶种扦插苗根际微生物分析及一株新种细菌的多相分类学研究

来源 :北京化工大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:piglolo1987
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近年来,根际微生物与植物的互作关系受到越来越多的关注,但扦插茶苗的根际微生物以及其对茶苗生长及成活的影响研究鲜有报道。本论文以云南省普洱市茶树良种场苗圃中扦插一年和两年的茶苗土壤为研究对象,分析了其微生物群落结构,分离培养了其根际微生物。为今后通过合成菌群等方法验证核心微生物与茶苗互作研究奠定了基础。对采集的一年苗和两年苗根际土壤和非根际土壤样本通过高通量测序进行了微生物结构分析。在样品测序中共得到1144个OTU,其中变形菌门丰度较高;通过高通量分离培养,两年苗根际土分离得到434株菌(224个ASV),一年苗根际土壤得到381株菌(210个ASV)。统计对比测序分析和分离结果后,确定了两方一致的68种微生物。从上述样本微生物分离培养鉴定中得到一株未被报告的疑似新种,命名为MSA67T,该菌株好氧且无运动性,革兰氏阴性,杆状,最佳生长温度是30℃,最适生长pH值为7.0,最适生长盐浓度为2.0%。主要极性脂为糖脂、磷脂酰甘油、二磷脂酰甘油和三种未识别的磷脂;主要脂肪酸为C18:1ω6c和/或C18:1ω7c(45.2%),C16:0(22.1%)和C18:1ω7c 11-CH3(23.7%)。MSA67T基因组大小为4.1 MB,G+C含量为63.63%,和同属菌株对比ANI值和d DDH值分别为小于95-96%和70%。进行多相分类学研究后得出结论,疑似新种MSA67T代表了Devosia属的一株新种,命名为Devosia sediminis。模式菌株是MSA67T(=CGMCC 1.18467T=KCTC 82192T)。
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