中药体内成分及其代谢产物的分析和鉴定研究有助于揭示中药的药效物质基础,阐明中药的代谢特点。由于中药成分结构的多样性、生物基质的复杂性和体内成分及代谢产物微量的特点,如何深入、高效地分析和鉴定中药体内成分及其代谢产物,特别是微量成分和代谢产物是中药领域急需解决的瓶颈问题。本论文运用高效液相色谱-高分辨质谱／多级质谱技术(HPLC-HRMS/MSn)和质谱树状图相似度过滤(MTSF)技术,研究和建立了一种中药体内成分和代谢产物发现和鉴定的新策略。通过使用全扫描模式获得化合物的一级高分辨质谱图,作为质谱树状图的树干,数据依赖扫描模式获得化合物的多级质谱图,形成树枝,构建检测到的化合物的质谱树状图,并将已知结构的化合物的质谱树状图作为模板导入自建的质谱树状图数据库。然后将生物样品中检测到的化合物的质谱树状图与自建质谱树状图库中的化合物的质谱树状图进行相似度比较,根据相似度结果,发现潜在代谢产物。经过研究表明,相似度匹配得分的阈值高于200分时,可以过滤掉大约80%的干扰,获得一定可信度的体内成分和代谢产物信息。通过运用这个新的策略,在淫羊藿主要活性成分朝藿定A、朝藿定B、朝藿定C、淫羊藿苷和宝藿苷Ⅰ5个黄酮单体和淫羊藿药材提取物给药后的大鼠的生物样品中,共发现和鉴定了115个代谢产物。并推测了淫羊藿黄酮的代谢途径。与广泛使用的中性丢失过滤(NLF)、产物离子过滤(PIF)和质量亏损过滤(MDF)技术相比,MTSF技术在代谢产物发现方面优于NLF和PIF技术,而与MDF技术互补；并且MTSF技术还能够用于结构鉴定,提高了代谢产物结构鉴定的效率。因此MTSF技术是从复杂生物基质中快速全面发现和鉴定中药体内成分和代谢产物的有利手段。