本课题系统收集了海南岛热带原始雨林区土壤样品1643份，建立了一个拥有3152份芽孢杆菌的菌株库，分离出苏云金芽孢杆菌野生菌株176株，菌株的分离率和出菌率为5.58％和10.71％。其中五指山热带原始雨林区出菌率最高，霸王岭最低，分别为14.54％和4.47％。原因是五指山山系大，是我国原生态保持得最好，没有人为破坏的热带原始雨林区，植被覆盖率高，土壤地表腐殖质层厚，而且昆虫种类和数量多。霸王岭热带原始雨林区出菌率和分离率较低，与霸王岭山体坡度陡峭，土壤被雨水冲刷，土壤沙化严重，腐殖质含量低密切相关。分析不同海拔苏云金芽孢杆菌分布律，发现Bt菌分布与海拔表现一定规律，一般海拔800-1400米Bt菌含量高。海拔小于800米的地区一般农林生产活动频繁，破坏植被和土壤结构，影响土壤微生态环境；一般随着海拔升高土壤植被覆盖率相应的降低，尤其土壤腐殖质含量明显降低，土壤沙化严重，结构松散，不利于Bt菌株生长繁殖。对部分菌株进行了16S rDNA序列分析鉴定和生长特性观察，通过显微镜观察到分离的苏云金芽孢杆菌的伴孢晶体类型有菱形、方形、圆形、椭圆形等，其中圆形晶体比例较高。为了鉴定分离菌株含有的杀虫晶体蛋白基因的类型，设计了47对基因鉴定的通用引物，利用PCR-RFLP方法鉴定分离的Bt菌株包含的杀虫晶体蛋白基因型，结果初步表明137株Bt菌含有cry1基因，38株含有cry2基因，分别表达130kDa和60kDa晶体蛋白，晶体为菱形；6株含有cry3基因，表达70kDa晶体蛋白，晶体呈方形；21株含有cry8基因，表达130kDa晶体蛋白，圆形晶体；8株含有cry4和cry11基因，表达130kDa或80kDa晶体蛋白，晶体也为菱形。对高产晶体蛋白菌株4b-1的cry1Ac基因进行了部分克隆，表明该菌株含有cry1Ac基因，可能对鳞翅目昆虫有高毒力。