目的探讨CMTM3在胶质瘤中的预后和鉴别诊断价值,并分析其作为潜在免疫治疗靶点的可行性以及相关性分析。方法从癌症基因组图谱（TCGA）数据库下载LGG（WHO II级和WHO III级）和其它肿瘤患者的转录组测序数据,从GTEX数据库下载正常病人的脑组织测序数据,比较CMTM3在LGG（WHO II级和WHO III级）和正常脑组织之间的表达差异。使用GEPIA数据库证实,与正常脑组织相比,CMTM3在LGG（WHO II级和WHO III级）的表达明显升高。结合TCGA中LGG（WHO II级和WHO III级）患者的临床和测序数据,分析CMTM3在各亚组中的表达差异有无统计学意义。单因素和多因素COX回归分析证明CMTM3是否是LGG（WHO II级和WHO III级）的独立危险因素。绘制CMTM3在LGG（WHO II级和WHO III级）整体和各亚组中的生存曲线,比较高低表达组之间总生存期（OS）有无明显差异。时间依赖性ROC曲线用来预测LGG（WHO II级和WHO III级）患者的生存结局。ROC曲线评价CMTM3的诊断价值。基因集富集分析（GSEA）寻找CMTM3可能参与的影响LGG（WHO II级和WHO III级）进展的信号通路。通过Starbase数据库预测调控CMTM3可能的miRNA。TIMER数据库用来分析免疫浸润情况。构建列线图模型预测LGG（WHO II级和WHO III级）患者不同时间下的生存概率。结果在大多数肿瘤中CMTM3高表达。与正常脑组织相比,CMTM3在LGG（WHO II级和WHO III级）中的表达明显升高。CMTM3在LGG（WHO II级和WHO III级）各亚组中的表达具有统计学差异。与WHO II级胶质瘤相比,CMTM3在WHO III级胶质瘤的表达明显升高。相比于IDH突变型,IDH野生型LGG（WHO II级和WHO III级）的CMTM3表达明显升高。1p/19q联合缺失患者CMTM3表达量明显低于未缺失患者。CMTM3的表达在年龄小于40岁亚组和年龄大于40岁的亚组之间同样具有显著差异。单因素和多因素COX回归模型结果表明CMTM3表达量是LGG（WHO II级和WHO III级）患者的独立危险因素。生存曲线显示在整个LGG中,低表达组的总体生存期（OS）明显长于高表达组。将LGG（WHO II级和WHO III级）分为多个亚组。在WHO III级的亚组中,CMTM3高表达组总生存期（OS）较短。IDH野生型的亚组中,CMTM3高表达组总生存期（OS）明显低于低表达组。1p/19q未缺失亚组、年龄大于40岁的亚组中,CMTM3的高表达也显示总生存期（OS）更短。时间依赖性ROC曲线用来预测患者的生存结局,预测LGG（WHO II级和WHO III级）患者1年和3年生存结局的AUC分别为0.821,0.750。使用ROC曲线评价CMTM3鉴别LGG和正常脑组织的效能,ROC曲线下面积（AUC）为0.990,特异度为96.2%,敏感度为96.4%,最佳阈值为3.935。CMTM3鉴别LGG（WHO II级和WHO III级）和GBM的AUC为0.847,特异度为73.0%,敏感度为87.5%,最佳阈值为6.035。CMTM3用来鉴别WHO III级和WHO IV级胶质瘤的AUC为0.783,敏感度为85.7%,特异度为62.1%,最佳阈值为6.053。CMTM3在鉴别IDH是突变型还是野生型方面也具有一定的诊断价值,AUC为0.762,敏感度为70.8%,特异度为78.4%,最佳阈值为4.090。基因集富集分析显示CMTM3在四个途径显著富集。结合多个数据库的联合预测,发现调控CMTM3最可能的miRNA是hsa-miR-149-5p。CMTM3与LGG中多种免疫细胞具有较高的相关性。结论CMTM3是LGG（WHO II级和WHO III级）的独立预后因素,可以作为LGG（WHO II级和WHO III级）新的预后标志物。CMTM3具有较高的诊断价值,可以辅助临床鉴别诊断LGG和正常组织、LGG和GBM、WHO III级和WHO IV级以及IDH是野生型还是突变型。CMTM3有望成为LGG（WHO II级和WHO III级）潜在的免疫治疗靶点。