随着西学东渐，西医引入中国，中国医学和西方医学发生冲突，结果是中医丧失了主导地位，而西医成为主流医学。两种类型的医疗模式，虽然有不同的理论，但它们都是以好的疗效为基础，所以我们应该是认识与反思两者之间的关系以及探索如何处理两者之间关系。目前已经过了一个多世纪，还没有实现中西医学的统一和理解，“结而未合”是中西医结合的现状。未来医学尤其是中西医学的发展问题，应当引起我们足够的重视。中国医学和西医之间的冲突说明这两种医学体系自身存在很大的不同。如果从哲学方向来进行探讨，一方面是本体论的差异。中国医学普遍认为“元气”是人生命的基础，离开了“元气”人就很难生存下去。中医通过运用阴阳五行学来构建人的生命系统，如此一来，就从宏观方面形成了实证医学理论体系。而西医人体的生命活动没有所谓的“元气”说，在西医看来，人体是由物质组成，人的生命活动是这些物质运动的结果。西医是从微观方面建立了实证医学理论体系。另一方面，方法论方面的差异。中医学在研究的过程中，将人体活动的功能状态作为研究对象，对人体功能状态的变化进行研究，如此形成了中国医学应用系统的方法，认识人体生命活动的独特系统。而西医将人体划分为众多的组成部分，从而去寻找反映人体病理过程的形状或者功能方面的改变。西医更加注重将生命现象看作是日常生活中所常见到的物理或者化学现象。由此可见，二者在研究的方法论方面存在一定的差异。除了上面两个方面外，二者研究对象存在一定的差异，西医经历了从把握对人的生命的理解，到研究解剖人的形态结构去模仿人的生理病理变化的过程。中医学的研究和对象一直都没有离开人的生命活动。从以上三个方面可以看出，中医和西医之间的差异是很大的，二者之间存在根本性的区别。由于我国现阶段同时存在着中医和西医两种医学理论，因此，从哲学的术语来进行考虑，我国存在两种不一样的医学范式。如果从历史主义方面来进行考虑，上述两种范式相互之间是不能够相同的，其也很难实现相互间的融合。因此，中医和西医两种医学理论将在我国社会长期并处，并且之间将存在一定的冲突。尽管如此，这两种不同的医学思想并非完全的各执一端，尤其在文化思想不断碰撞的全球化的时代，我们也看到其相互会通的可能性。而从其思想来看，他们虽然存在冲突，但也不无融汇之处。最后，分析了中国和西方医学相结合的未来发展趋势，再结合真理一元概念的基础上，笔者认为，两种医学体系最终会融合在一起，进而被新的医学理论取代。中医、西医的发展其主要依赖于一个新的医学范式出现。这种范式不仅能够继承西方医学，并可以包含中国医学。这种新的范式还能够解释中国医学和西方医学的所有方面，而且还能够为医学的发展开辟新的道路。当然，新医学范式的出现虽然要一定的时日，但好像已经可以看见一丝曙光。