产前超声筛查与染色体核型分析及CNV-seq在产前诊断中的应用价值

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目的:探讨产前超声筛查与染色体核型分析及基因组拷贝数变异测序(copy number variation sequencing,CNV-seq)三项技术在临床产前诊断中的应用价值,为产前诊断及遗传咨询提供理论基础。方法:以2019年10月至2020年9月于河北医科大学第二医院行产前超声筛查的孕妇为研究对象。通过产前超声初步判断胎儿是否存在超声结构或超声软指标异常。对超声提示异常的病例,经孕妇及其家属知情同意后,行羊膜腔穿刺+染色体核型分析或基因组拷贝数变异测序(CNV-seq),详细记录各项结果,并结合超声结果进行分组统计及综合分析。结果:1.640例孕妇中产前超声共提示8个系统42种结构异常、10项超声软指标异常;2.超声结构异常组中单一系统结构异常的异常核型检出率8.2%,多系统结构异常的异常核型检出率50%,对照组异常核型检出率2.8%。对上述三组异常核型检出率行卡方检验P值均小于0.05,差异均有统计学意义。且超声提示心血管系统和脊柱四肢异常的病例在染色体核型异常病例中占比最高;3.超声软指标异常组单一超声软指标异常的异常核型检出率为5.4%,多项超声软指标异常的异常核型检出率11.9%。两组异常核型检出率比较P<0.05,差异有统计学意义;4.应用Logistic回归分析结果显示NT异常、心室强光斑、鼻骨异常、四肢短小及小脑延髓池增宽,与染色体核型异常关系均密切(P<0.05)。心室强光斑预测染色体异常的敏感性最高(48.4%),小脑延髓池增宽预测染色体异常的特异性最高(96.9%);5.超声结构异常组CNV-seq异常检出率为20.3%,核型分析联合CNV-seq测序异常检出率21.3%;超声软指标异常组CNV-seq异常检出率12.3%,核型分析联合CNV-seq测序异常检出率12.6%。两组核型分析与CNV-seq测序异常检出率比较P<0.05,差异有统计学意义。两组核型分析与联合筛查异常检出率比较P<0.05,差异有统计学意义;6.CNV-seq还可额外检出致病性异常7例、良性5例、临床意义不明6例、可能致病性3例、可能良性3例;回顾核型分析结果,发现8例染色体易位和2例染色体倒位,CNV-seq均未检出。结论:1.产前超声可以筛检出大部分胎儿生长结构异常,且对染色体异常有一定预测作用。2.有超声异常胎儿染色体异常检出率高于无超声异常胎儿,且随超声提示异常结构及软指标数目增多,染色体异常风险增高。3.对于染色体的检查,核型分析联合CNV-seq测序检出率明显高于任何单一方法检出率。CNV-seq可以额外检出更多的致病性异常,但对于某些片段的易位、倒位,检出率不如染色体核型分析,因此CNV-seq不可完全代替核型分析。4.同时特异性超声表型可以预测基因异常的风险,准确的基因型也可以提示表型出现的可能。在遗传咨询中,对于高危孕妇,建议进行联合筛查,避免异常情况的漏诊。
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