西方发达资本主义国家已经在实践中证实,股权激励制度作为一项重大的激励机制创新,在降低公司所有者和经营者之间的代理成本、提升公司价值和推动经济发展等方面发挥了重要作用。相比在国外取得的巨大成功和广泛应用,股权激励体制在我国的起步较晚。2005年的股权分置改革,解决了制约中国资本市场发展的重大制度性缺陷,为股权激励的实施扫除了制度层面的障碍。近几年,随着有关股权激励制度的法律法规的出台,我国的股权激励制度走上了规范化的道路,但是,股权激励计划在我国上市公司,特别是国有公司中的实施比例相对较低,使股权激励制度这种优良的长期激励机制不能为提升我国上市公司的价值和促进经济发展做出贡献。学者们对自由现金流量的经济后果和股权激励的影响因素都有研究,但是将两者结合起来并考虑公司治理机制对两者之间关系的影响的研究很少。以此为启示,采用规范研究与实证研究相结合的方式,探讨自由现金流量、代理成本与股权激励计划选择的关系,以及公司治理机制对两者之间关系的影响,具有一定意义。在规范研究部分,对国内外相关研究成果进行了梳理、归纳与整理。同时,对相关理论进行了概述,并结合理论对自由现金流量、代理成本与股权激励计划选择的关系,以及公司治理机制对自由现金流量与股权激励计划选择关系的影响进行了理论分析,为实证研究模型的设计提供了有力的支撑。在实证研究部分,选取了2006年至2012年我国A股上市公司数据作为研究样本。首先,对样本数据进行描述性统计分析和相关性分析；然后,对全样本和国有公司样本进行多元LOGISTIC回归分析。根据回归结果进行比较分析,得出以下研究结果：(1)自由现金流量越多的上市公司,越不倾向于选择股权激励计划,对于国有、所处地区市场化程度低和非两职合一的公司而言,自由现金流量越多的上市公司,更加不倾向于选择股权激励计划。(2)对于国有公司,市场化程度低、董事会独立性低和股权制衡度低的国有公司,自由现金流量越多,公司更加不倾向于选择股权激励计划。基于以上研究结果,可以得出以下启示：加快市场化进程、培育职业经理人市场、发挥银行的债权人治理作用、深化国有公司组织关系改革、强化信息披露机制、强制现金分红、完善公司内部治理结构。