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Illumina测序技术是近两年迅速发展的一种高通量的测序技术，相对于传统Sanger测序技术，高通量合成测序具有信息覆盖度广，测序程度深的显著特点。Illumina测序技术进行的转录组分析是近年来建立的对基因表达宏观分析方法，具有信息涵盖量大，数据冗余性低，分析准确，可检测到低表达的基因存在，以及不需要具有基因组学背景就可以分析新物种的转录表达概况等多方面优点。 本文采用转录组Illumina测序的方法对亚洲玉米螟的发育的各阶段转录组进行序列测定，获得总共2，490，000，480个碱基，拼接为27，666，672条clean reads，reads平均长度为93bp。最后组装成72，057个Unigene，其平均长度为400bp。获得的序列用BLASTX与NCBI非冗余核酸序列数据库进行比较(E值为10-5)，结果表明11.3％的序列相似度高于80％，其余88.7％的序列相似度分布于15％到80％，和其他物种序列比对结果表明与黑脉金斑蝶(Danaus plexippus)匹配度最高，为28.1％；赤拟谷盗(Triboliun castaneum)次之，为11.1％；其余依次为家蚕(Bombyx mori)，为8.4％；冈比亚按蚊(Anopheles ganbiase)，为4.3％；蝶蛹金小蜂(Nasonia vitripennis)，为3.2％；印度跳蚁(Harpegnathos saltator)，为3.0％；切叶蚁(Acromyrmex echinatior)，为2.7％。COG、GO、KEGG注释和分析后共获得72，057条具较高注释可信度的Unigene，与昆虫免疫直接相关的Unigene190条。 分析亚洲玉米螟二龄、三龄、四龄、五龄、预蛹和蛹数字表达谱，筛选得到共89946条差异基因，其中40128条为上调的基因，49818条为下调的基因。转录组测序所获得的190条免疫类相关的Unigene中筛选了模式识别受体基因BGRP(GNBP)家族和PGRP家族作为代表分析其在各个表达谱的表达差异，结果表明这2个基因家族均从三龄开始随着龄期的增加基因表达上调，表明这两个基因在不同龄期的发挥的功能不同。