21世纪是知识经济的时代。基于这种认识,中国政府决定从2006年开始,把推动整个国民经济发展的引擎转换到“自主创新”上来,但自主创新绝非易事。面对五花八门的理论观点与刚刚起步的自主创新实践,本文说明了以下观点:中国的自主创新与经济转轨同时进行,这决定了中国对自主创新的理论认识与实践准备都尚不充分。今天,中国的自主创新不仅不可能一劳永逸、一蹴而就,甚至都未必会自动发生。自主创新远非解决资源投入瓶颈这么简单的问题,而认识发展规律、转变体制机制、优化创新要素是解决研发投资饥渴的根本出路,教育的发展则将进入质与量并重的新阶段。人才匮乏、体制僵化与起点偏低的同时存在,共同决定了中国国家自主创新体系建设的长期性、艰巨性与复杂性。为说明这一基本观点,本文从定性与定量两个角度展开了对中国国家自主创新体系的分析。定性分析兼顾了技术能力成长机制和创新体系的组成要素两个方面。在一个相对抽象、并因而具有一般性的技术能力成长机制分析中,说明了技术能力成长与持续自主创新之间的因果关系,并通过“技术能力成长空间”的范畴综合了影响技术能力成长的组织因素、技术因素及市场等非技术因素。体系组成要素分析中涵盖的创新参与者包括作为创新体系治理结构核心的中国政府、身兼教育与科研双重职能的大学、多年来处于中国科技系统改革中心位置的公立科研院所,以及千千万万的民族工业企业。从方法上,对中国国家自主创新体系的每一类组成要素的分析都是在回顾其历史路径的基础上,进一步讨论了其在中国国家自主创新体系建设中的现状、机遇与挑战。在上述定性分析的基础上,本文利用系统动力学模型描述了中国国家自主创新体系的可能情形,就有关政策安排进行了模拟,并结合定性分析中的结论,对实现模拟预期效果的有关影响因素进行了分析。在此过程中,建立系统动力学模型的计量分析,是在一系列相关研究的基础上,结合科学技术发展的当代特点,对后发国家知识生产及积累机制研究的改造与应用。而系统动力学模型的基本结构则是国家自主创新体系中产业、教育及公共研发三大子系统,其中的核心是产业子系统的技术能力成长及相关的子系统间联接互动。最后,本文以技术能力成长为出发点就中国自主创新的有关政策安排进行了总结,并从研究方法等角度展望了文中有关问题。