糜子(Panicum miliaceum L.)是最古老的作物之一,其具有耐盐、耐碱、耐旱、耐贫瘠、生育期较短等特点,可以在未开垦地和荒漠中进行种植。糜子长期以来一直是欧亚大陆的干旱、半干旱地区的重要主食,并且具有一定的营养价值和药用价值。在世界范围内,除中国外,印度、俄罗斯、伊朗、蒙古、波兰、乌克兰等国都是糜子的主要栽培地。在我国,糜子主产区包括内蒙古、陕西、宁夏、甘肃、山西、东北地区以及河北北部等。然而,该作物的地理起源仍然是一个有争议的问题,目前主要有两种假设:即中国单一起源、中国和东欧分别独立起源。为了进一步探讨糜子的起源问题,本研究对来自中国、俄罗斯、乌克兰、波兰和印度的190个糜子地方品种的核糖体DNA ITS和ETS区序列进行分析,根据直接测序的结果,将这190个样本划分为18种类型(I-XVIII),并进一步归为5组(A-E)。针对每个类型均选取1-3个样本进行ITS区克隆测序分析,共检测到13个变异型(variant1-13),其中variant 1发现于所有类型中,并在针对13个变异型的中介网络分析中处于网络树的中心,说明其可能为最原始序列。因此,我们推测具有单一的variant 1且在ITS和ETS区均表现为纯合的I型可能为最古老的糜子类型。由于本研究中I型仅在中国和印度的样本中出现,而印度缺乏早期的考古遗址,不可能作为糜子的起源地,因此本研究的结果支持中国是糜子起源中心的观点。另一方面,归于D组和E组的类型均分布于国外,其ITS区特有的变异型从中介网络分析来看均起源于variant 1,且其中一半比其他变异型更多一步核酸突变,因此推测这些国外的糜子类型可能是由中国的糜子类型在向西传播过程中形成的,东欧或者糜子向西传播路线上的某地可能是D组和E组糜子类型形成的次级驯化地。本研究的结果将为糜子的起源与传播,乃至北方旱作农业的起源问题的研究提供有价值的分子遗传学信息。