作为公共战略性投资的政府科技计划事关国家整体科技竞争力的跃升,肩负引领经济社会发展的重要使命。有效的政府科技计划评估有利于保证政府科技计划完成的质量,对国家经济社会发展具有重要的作用。而深入分析政府科技计划评估相关主体之间的关系,是有效开展政府科技计划评估工作的关键。现有的关于政府科技计划评估主体关系的研究大多是从系统宏观层面展开,较少进行微观的建模分析。为此,本文从微观建模方面对政府科技计划评估相关涉及的公共管理部门、专业评估机构和项目承担单位等主体间的关系进行研究,并结合具体案例进行分析。本文先对不考虑专业评估机构参与的政府科技计划评估相关主体关系问题进行研究,构建了只有公共管理部门以及项目承担单位两个参与主体参与的委托代理模型。研究发现,公共管理部门对项目承担单位评估监督的能力水平对公共管理部门、项目承担单位的最优努力程度以及公共管理部门的最优收益有促进作用。再对考虑专业评估机构参与的政府科技计划评估相关主体关系问题进行研究,构建了公共管理部门、专业评估机构以及项目承担单位三个参与主体参与的委托代理模型。研究表明,当公共管理部门对项目承担单位评估监督的能力水平较强时,公共管理部门自身会付出较多的努力水平对项目承担单位进行评估监督;而当该评估监督的能力水平较弱时,公共管理部门会付出较少的努力水平对项目承担单位进行评估监督。最后结合具体案例,对考虑上述两种情况下的公共管理部门最优收益对比发现,当公共管理部门对项目承担单位评估监督的能力水平较强时,公共管理部门依靠自身对项目承担单位进行评估监督为最优;而当公共管理部门对项目承担单位评估监督的能力水平较弱时,公共管理部门应积极引入专业评估机构对项目承担单位进行评估监督。这同时启示我们,随着社会的进步发展,公共管理部门职能日益增多,其对具体项目承担单位评估监督的专业能力日益不足,越来越难以适应快速变化的技术和质量等多方面要求,应积极引入专业评估机构对项目承担单位进行评估监督,以实现科技资源效益的极大。