结核分枝杆菌DNA聚合酶Ⅲ的结构与功能研究

来源 :中国科学院研究生院 中国科学院大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhumuray
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
结核分枝杆菌(MTB)是人类重要病原菌之一,全世界大约有三分之一的人口遭受感染。近年来,多耐药(MDR)和泛耐药(XDR)MTB的出现,向结核病治疗提出了严峻的挑战。随着结核分枝杆菌耐药性的出现和日益加重,对菌株耐药性的快速检测在临床上具有重大意义。目前平板生长药敏试验是一种标准方法,但平板生长法太慢(3-4周),不能快速得到患者所感染结核菌的耐药谱,使病人不能得到及时治疗。如果能够找到结核分枝杆菌增殖较慢的根本原因,并针对性地采取措施,对于结核菌耐药性检测无疑是一个重大突破。   导致结核分枝杆菌增殖慢的因素较多,但其DNA、RNA和蛋白质合成速率是关键因素,即DNA复制、转录和蛋白质翻译等分子事件至关重要。因此,负责DNA新链合成的聚合酶体系的结构与功能信息会为揭示此问题提供重要依据。结核分枝杆菌基因组中有两个DNA聚合酶(PolⅢ)α亚基基因(dnaE1和dnaE2)。dnaE1基因缺失是致死性的,因此,这个基因被认为是主要的DNA复制聚合酶。本论文以结核分枝杆菌DNA聚合酶全酶的结构和功能为切入点,对结核分枝杆菌的基因组稳定、生长缓慢和耐药性产生机制深入研究,从而加深理解基因组稳定与病原菌产生耐药性的关系,为结核分枝杆菌的耐药性快速诊断、开发新的抗结核药物提供理论依据,这不仅是基本的生命科学问题,也是人类重大传染病防治领域研究的重要课题之一。   在E.coli中,基因组复制由DNA聚合酶Ⅲ(polⅢ)负责,它由三个组件构成,即复制核心(replication core)、钳装载器(clamp loader)和滑动钳(sliding clamp)。MTB基因组测序的结果表明,MTB的DNA polⅢ也由这三部分组成。本研究以MTB H37Rv的DNA polⅢ为研究对象,从结构和生化的角度展开研究。   通过X射线衍射的方法成功解析出MTB H37Rv的DNA polⅢ重要亚基β clamp的晶体结构,分辨率为2.9埃。该结构呈头-尾相连的环状形式,与E.coliβ clamp晶体结构类似,整个环的直径大约为80 A,直径为35 A,但N-terminal face的负电势比E.coli的更强。根据晶体结构,设计源自MTBα和δ的不同小肽,研究它们与β clamp的相互作用和动力学常数。应用分析型超速离心方法确定了β在溶液中以二聚体的形式存在,通过Far-western方法确定了β clamp与t存在相互作用。   建立了E.coli DNA polⅢ的replication core和clamp loader的共表达纯化系统,简化了表达纯化和组装过程,缩短了实验流程。采用缺口双链DNA作为底物和低电压核酸琼脂糖电泳,建立了E.coli DNA polⅢ酶活检测体系,为建立TB DNA polⅢ的体外酶活系统、以及其它复杂酶体系,提供了有益的参考和借鉴。   获得了MTB DNA polⅢ所有亚基的克隆,应用共表达方法,表达和纯化clamp loader并测定其ATP酶活和clamp loading活性。通过IPTG诱导的GroESL分子伴侣系统和阿拉伯糖诱导的araBAD启动子表达载体的分步表达,成功解决了DNApolⅢε亚基的可溶性表达,获得了ε蛋白。利用NEB Impact系统和大纯化标签载体解决了TB DNA聚合酶Ⅲ的α亚基的可溶表达问题。   综上,本研究通过对MTB DNApolⅢ的β亚基晶体结构及其它亚基的生化性质的研究,为结核分枝杆菌DNA聚合酶的深入研究打下基础,也为结核病新药的研发提供了一些理论依据。
其他文献
本文通过对荣华二采区10
近30年来,随着生产过程的自动化,DCS(Distributed Control System)在工业控制领域发挥了越来越重要的作用,为电力和化工等工业企业的安全、稳定、高效生产发挥了不可替代的作
请下载后查看,本文暂不支持在线获取查看简介。 Please download to view, this article does not support online access to view profile.
期刊
本论文对单站无源定位的多种经典算法做了介绍与研究,还提出了新的定位算法,并对这些算法做了计算机仿真,对各算法的定位精度、收敛速度等性能进行了分析与比较。 在方位测量
由于物理成像系统和成像环境的限制,如光学模糊、运动模糊、下采样和系统噪声,人们很难得到一幅理想的高分辨率(High Resolution,HR)图像或图像序列。超分辨率(Super-resolut
本文通过对荣华二采区10
复杂网络的社区检测问题是指利用网络中节点之间相互连接的拓扑结构关系,找出图形中内部连接相对紧密、外部连接相对稀疏的社区结构。针对这些社区结构的研究,有助于我们更好
本文的内容主要围绕适应铒离子高掺杂的新型材料-碲酸盐玻璃的特性展开的。首先比较了各种光放大器的优缺点;研究了普通掺铒光放大器三能级、四能级的数学模型和高掺杂理论的数
请下载后查看,本文暂不支持在线获取查看简介。 Please download to view, this article does not support online access to view profile.
期刊
低温等离子体聚合是异于常规化学聚合的一种新型制备材料的方法,可以实现材料表面的改性。而金属医用生物材料的表面特性在某种程度上制约了金属材料的血液相容性。本论文的主