目的:多个数目不等的串联重复序列(VNTR)的分析被认为是病原菌株分型、追踪传染源和传播链的工具。但目前缺乏对特定地区和时期内分离的麻风菌株进行基因分型和麻风病传播链研究的经验。因此，有必要深入研究，为控制传播提供对策。 材料与方法:从云南省丘北县2002-2006年收集的84例患者皮损中提取麻风菌DNA，采用(AC)9、6-7、(GTA)9、(AT)17、(AC)8a，(AT)15，(AT)18七个VNTR位点的MI．VA基因分型，观察不同VNTR基因型与地理分布的关系；进一步与现场流行病学调查结合，开展传播链的研究。 结果: (1)对研究地区的84株麻风菌、7个VNTR位点的MLVA分型，采用PAlJP 4．0软件进行系统发育树分析揭示：依据(GTA)9的重复序列数的变化，可分为(GTA)9位点为9个拷贝的A、10-15的B、C组和24-26、>26的D和E组。结合菌株的地理分布，(GTA)9位点拷贝数为9的A组菌株，聚集分布在该县的北部；B株分布在西北部、C株分布在东南和中部的二个乡；但D、E菌株基因型多变，散在分布在其它乡村。 (2)来自北、西北部的多个高发家系内的菌株为A、B菌株。多数高发家庭内患者菌株的VNTR基因型一致，但各家庭之间菌株基因型不完全相同。同乡、I临近乡的多数菌株基因型与高发家系内菌株基因型一致或相似。 (3)基因型一致或高度相似的A菌株不仅具有地理聚集性，而且占全总病例数的比例较高(21/84)。2006年在同一地区发现较多的A株。以赶集为主的社会经济接触可能是麻风病传播渠道之一。 结论: (1)无论从家庭内还是较小区域内收集的菌株的分型结果显示，VNTR基因分型适合短传播链的研究。 (2)有多个患者的高发家系可能作为疫源，使基因型一致或相似的菌株向同村邻居、邻近乡村传播，从而在该地形成聚集株。有意义的是，由于不断有一定数量的A菌株的患者在该地出现，提示该菌株可能为优势株，使疾病继续传播流行。 (3)需要较长时期的研究观察菌群在时间和空间的进化、优势株是否持续存在。菌株分型有助于证实预防治疗或干预措施能否是阻断优势株的传播。