猪DGAT1基因和Ob基因多态性及其与背膘厚的关系

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DGAT1基因和ob基因是与动物脂肪沉积有关的两个重要基因。本试验对猪DGAT1和ob基因进行SNP扫描和多态性分析,以期在这两个基因上找到与猪背膘厚有关的分子标记,为优质、高产瘦肉型猪选育提供一条分子育种途径。猪DGAT1研究方面,本研究对莱芜猪DGAT1外显子6至外显子8共476bp的序列进行了克隆、测序(GenBank收录号:DQ289596),在外显子6和8上检测到两处SNPs,DGAT1内含子6和内含子7上有保守的GT-AG拼接识别序列;在莱芜猪和西方猪种外显子6至8未发现类似牛K232A的错义突变;针对大白猪和莱芜猪外显子8上的SNP进行PCR- SSCP检测,发现莱芜猪群体处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),大白猪群体均为CC纯合体;克隆了猪DGAT1 5’调控区的部分序列(737 bp),在-241bp(相对于起始密码子ATG)发现一处由单个腺嘌呤(A)缺失产生的新SNP位点(定义为等位基因Del(A) ) (GenBank收录号:DQ463321-22);对大白猪、大莱二元杂交母猪、杜洛克猪和莱芜猪进行了PCR-SSCP检测,结果发现莱芜猪群体Del(A)等位基因频率最高,所检测的30头个体均为Del(A)/ Del(A)纯合型,所检测的四个群体均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);大莱二元杂交母猪群体不同基因型的猪背膘厚差异不显著(P>0.05),在仔猪初生重方面,Del(A)/ Del(A)个体与+/Del(A)个体差异显著(P<0.05),该位点对初生重的加性效应为0.09868kg,显性效应为0.04574kg。在ob基因的研究方面,本研究在ob基因5’调控区-2835位点找到一个新的SNP多态(G2835A)。对莱芜猪、大白猪、商品杂交猪、杜洛克猪和大莱二元杂交母猪进行了该位点的多态性检测,其中莱芜猪群体中G等位基因频率最低(0.32),杜洛克猪群体G等位基因频率最高(0.93);莱芜猪、大白猪、杜洛克猪和商品杂交猪群体处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);大莱二元杂交母猪群体偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.01);对该位点不同基因型背膘厚之间进行最小二乘分析,结果显示,不同基因型个体的背膘厚差异不显著(P>0.05)。本研究分别在猪DGAT1基因和ob基因上找到了3个和1个单核苷酸多态性标记(SNP),对位于5’调控区的SNP标记与猪背膘厚的关系进行
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