植物乳杆菌烈性噬菌体P2的灭活及基因组学的研究

来源 :内蒙古农业大学 | 被引量 : 5次 | 上传用户:tmdjapanese
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乳杆菌是乳制品发酵中的重要菌株,但乳杆菌噬菌体的普遍存在给乳品行业带来了巨大的危害。因此如何使噬菌体灭活,已成为乳品行业越来越重视的问题。本实验评价了不同热处理方式(不同培养基:复原脱脂乳,三镁明胶,MRS;不同加热温度:63、72、90℃)、不同化学杀菌剂(乙醇、异丙醇、次氯酸钠、过氧乙酸)在1h内对植物乳杆菌烈性噬菌体P2的灭活效果。结果表明,噬菌体P2表现出一定的耐热性,其在90℃,1Omin和72℃,40min可完全失活。复原脱脂乳对该噬菌体提供了最好的保护作用,MRS的保护效果最差。除过氧乙酸外,其他三种化学杀菌剂对P2的灭活效果均随着浓度的上升而逐渐加强。100%的乙醇可达到较好的灭活效果,使其减少4.31个对数级。100%的异丙醇可使其减少5.98个对数级,优于100%乙醇。用800ppm次氯酸钠处理30min,400ppm次氯酸钠处理50min,可使噬菌体P2完全失活,同时次氯酸钠也是唯一可以使该噬菌体达到完全灭活的化学杀菌剂。不同浓度的过氧乙酸对噬菌体P2的存活没有较大影响。采用IlluminaHiseq 4000对乳杆菌烈性噬菌体P2进行全基因组测序。结果显示:噬菌体P2基因组为线性基因组,长度是78kb,平均GC含量为39.28%,共编码96个CDS,2个tRNA。此外,通过比较基因组学分析发现,噬菌体P2与同宿主噬菌体P1之间同源性高达99%。噬菌体P2与烈性乳杆菌噬菌体B2的比较基因组学显示:在尾部蛋白(g18),尾部卷尺蛋白(g25),尾丝蛋白(g28)等与尾部蛋白合成有关的蛋白方面同源性较低,这些蛋白与次氯酸钠对噬菌体P2的灭活有关;在主要结构蛋白(g16、g17),次要结构蛋白(g26、g27)等与衣壳蛋白合成有关的蛋白方面同源性较低,这些蛋白与醇类及过氧乙酸的灭活都有着内在的联系;但在DNA复制模块相似度较高。另外,一些编码假定蛋白的基因也差异较大,推测其在环境适应时产生一些功能不明确的基因进化,还有待进一步研究。
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