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MEF2A和MEF2D基因在包括不同类型肌肉组织在内的多种组织生长发育中具有调控作用,对家畜家禽的生产性能、尤其是骨骼肌的产量与品质有重要影响。不同物种中的研究均表明,MEF2A和MEF2D基因多态性与多项生产性状有关。骨骼肌是肉鸭生产的主要产品,探究鸭MEF2A和MEF2D基因分子标记多态性及其对生产性能的影响,有助于分子标记辅助选择和优质肉鸭新品种的培育。然而,关于MEF2A和MEF2D基因编码区CAG重复及其侧翼序列中SNP的多态性以及他们对生产性能的影响,还缺少研究报道。并且,农华麻鸭GF2系作为新近培育的优质肉鸭品系,其生产性能还缺乏系统的测定与分析。因此,本研究测定并分析了农华麻鸭GF2系肉鸭的生产性能;克隆了鸭MEF2A和MEF2D基因编码区内CAG重复序列及其两端侧翼序列,鉴定了它们在农华麻鸭GF2系肉鸭中的多态性;初步分析了CAG重复多态性与其侧翼序列中SNP间的关系;最后,对CAG重复基因型和侧翼序列中SNP位点、SNP单倍型组合与生产性能进行了关联分析。主要研究结果如下:(1)9周龄时,农华麻鸭GF2系公鸭的体重、胸肌重、腿肌重、屠宰率、胸肌率和腿肌率达到了3476.58g、386.25g、249.71g、87.72%、15.81%和10.22%,母鸭达到了3009.41g、358.62g、224.08g、89.96%、16.31%和10.19%;公鸭的胸肌肉色L值、腿肌肉色L值、胸肌剪切力和腿肌剪切力为41.23、39.77、39.90N和43.86N,母鸭为42.17、38.04、34.71N和40.26N。(2)0-8周龄期间,农华麻鸭GF2系公母鸭体重均显著上升(P<0.05),但9周龄体重与8周龄体重差异不显著。0-9周龄期间,公母鸭日增重均先上升后下降,公母鸭日增重均在4-5周龄最高。9周龄公鸭的8个体尺性状均高于母鸭,其中胸宽和胫长差异显著(P<0.05)。9周龄公母鸭的腿肌肉色A值差异显著(P<0.05),其余7个肉质性状差异不显著。9周龄公鸭的屠体重、半净膛重、全净膛重、瘦肉重、腿肌重、腿肌率和腹脂率均显著高于母鸭(P<0.05),其余10个屠宰性状公母鸭差异不显著。(3)在本试验群体中,MEF2A基因编码区CAG重复及其侧翼序列未检测到多态性;MEF2D基因编码区内CAG重复存在3种等位基因,即A(重复次数为40、等位基因频率为0.931)、B(重复次数为49、等位基因频率为0.054)、C(重复次数为37、等位基因频率为0.016),以及3种基因型,即AA、AB、AC(基因型频率为0.846、0.108、0.046);MEF2D基因编码区内CAG重复的侧翼序列中检测到9个SNP位点(命名为SNP1-9)、3个单倍型(命名为H1、H2、H3)和3个单倍型组合(H1H1、H1H2和H1H3),9个SNP位点均只存在2种等位基因和2种基因型,SNP1/8/9完全连锁、SNP2-7完全连锁,H1和H1H1是主要单倍型和单倍型组合。(4)在本试验群体中,CAG重复为AC型的侧翼序列中每个SNP位点的突变频率均与AA和AB型差异明显,而AA和AB型间则很接近。同时,CAG重复基因型与其侧翼序列中SNP单倍型组合具有一定的对应关系,CAG重复为AA、AB和AC基因型的个体,其单倍型组合分别更多的表现为H1H1、H1H1和H1H3。(5)在本试验群体中,MEF2D基因CAG重复多态性与2周龄体重,9周龄胫长、胸肌肉色A值和胸肌厚显著相关(P<0.05)。CAG重复AA型个体的2、3、5、6、7周龄体重,0-1、1-2和2-3周龄日增重,以及9周龄胸宽、胫长、胸肌肉色A值、胸肌厚和皮脂重均显著大于AC型个体(P<0.05);CAG重复AB型个体的3、5、6、7、8周龄体重,2-3、5-6、6-7周龄日增重,以及9周龄胸宽、胫长、胸肌肉色A值、屠体重、半净膛重、皮脂重、胸肌率均显著大于AC型个体(P<0.05);而CAG重复AA型个体与AB型个体间在所有性状上均无显著差异;表明MEF2D基因CAG重复AC基因型不利于肉鸭生产性能。(6)在本试验群体中,MEF2D基因CAG重复侧翼序列中SNP1/8/9与胸肌肉色L值显著相关(P<0.05),其余SNP位点与生产性状无显著相关。同时,单倍型组合对胸肌肉色A值有显著影响(P<0.05)。H1H1型个体的1、2、3、5、6、7和8周龄体重,0-1、1-2、2-3周龄日增重,以及9周龄胸宽、胫长、胸肌肉色A值、腿肌重和皮脂重均显著大于H1H3型个体(P<0.05);H1H2型个体的1、2、3、5、6、7周龄体重,0-1、2-3周龄日增重,9周龄胸宽、胫长、胸肌肉色A值、皮脂重、胸肌率均显著大于H1H3型个体(P<0.05);而H1H1型个体和H1H2型个体间仅半净膛率和全净膛率差异显著(P<0.05);表明MEF2D基因CAG重复侧翼序列中H1H3单倍型组合不利于肉鸭生产性能。综上所述,农华麻鸭GF2系9周龄肉鸭的生产性能良好,该群体中未检测到MEF2A基因编码区内CAG重复及其侧翼序列的多态性而MEF2D基因编码区内CAG重复及其侧翼序列的多态性丰富,MEF2D基因编码区内CAG重复的多态性对其侧翼序列中的SNP突变频率与SNP单倍型组合均有一定影响,并且该CAG重复的基因型及其侧翼序列中的SNP单倍型组合均对多项生产性能有显著影响。本研究的结果可为优质肉鸭新品种培育中分子标记辅助选择的进行提供理论参考。