益气清毒防癌茶的网络药理学研究

来源 :江西中医药大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ytli1981
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目的:运用网络药理学的方法,探讨益气清毒防癌茶预防肺癌的有效化学活性成分及潜在分子作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库查询益气清毒防癌茶的化学成分及药物作用靶点,并将口服生物利用度(OB)设置为大于等于40%,将类药性(DL)规定为大于等于0.18,将同时满足以上两者条件的有效活性成分和靶点挑选出来,经CNKI数据库查阅文献核对和补充靶点。对靶点结果在Uniprot数据库进行核对校正,最终得到益气清毒防癌茶的有效靶点信息。基于人类基因数据库(Gene Card),以“肺癌(lung cancer)”为关键词,将物种设定为智人(Homosapiens)检索与肺癌相关靶点,利用数据库Uniprot查找可能的目标蛋白对应的基因名称,从而使目标蛋白标准化。在Venny这一在线软件作图工具平台分别录入益气清毒防癌茶和肺癌的靶点基因,通过绘制韦恩图可以得到两者靶点基因的交集,并作为潜在的作用靶点。将筛选出的潜在作用靶点基因导入STRING蛋白质-蛋白质互作网络(Protein-Protein Interaction Network,PPIN),将种类定义为Homosapies进行分析,获取蛋白和蛋白之间的相互作用信息。在Cytoscape 3.7.1软件里导入目标靶点绘制PPI地图(即蛋白质相互作用网络图),其中颜色的深度变化和节点大小代表度值的大小,根据节点度值的大小选择核心目标靶点。通过DAVID平台对潜在的作用靶点基因进行富集分析,得到富集分析基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG),预测益气清毒防癌茶的化学成分作用主要靶点和潜在生物活性机制作用,探讨清益气清毒防癌茶最可能的作用机制。结果:网络药理学研究结果显示:从益气清毒防癌茶中共筛选得到133个活性成分,其中活性化学成分较活跃的有槲皮素(quercetin)、山奈酚(kaempferol)、儿茶素((+)-catechin)、异鼠李素(isorhamnetin)、白桦脂酸(mairin)、华良姜素(jaranol)、刺芒柄花素(formononetin)、毛蕊异黄酮(calycosin)、柚皮素(naringenin)、植物甾醇(stigmasterol)等。共获得有效靶点1244个靶点,删除重复值后剩294个靶点。通过Gene Card数据库获得肺癌相关基因靶点23648个,根据中位数筛选最后得到相关性较大的370个基因靶点。取两者交集,得到药物疾病交集靶点91个,即药效基靶点。通过DAVID数据库富集分析GO得到生物学过程(BP)535个,细胞组成(CC)50个,分子功能(MF)87个;KEGG富集分析显示117条信号通路。其中,癌症通路(hsa05200:Pathways in cancer)、癌症中的蛋白多糖(hsa05205:Proteoglycans in cancer)、缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路(hsa04066:HIF-1 signaling pathway)、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路(hsa04668:TNF signaling pathway)等通路较为重要。结论:本研究网络药理学表明益气清毒防癌茶对肺癌具有预防作用,在癌症通路、癌症中的蛋白多糖、缺氧诱导因子-1信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等多种信号通路中利用槲皮素、山奈酚、儿茶素等多个活性成分作用于EGFR、TP53、AKT1、PTEN等基因,通过抑制细胞的周期和组织内血管生成的作用达到预防肺癌细胞的发生发展。
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