房地产行业的兴衰在很大程度上影响着一国的经济以及居民生活。而处于房地产行业发展初期的中国，房价仍保持着快速的增长，以有效的政策调整房价成为亟需解决的问题。同时由于中国存在区域发展不平衡的现象，很多在全国范围内实施的房价调控政策应用到具体地区时效果并不明显。因此不同城市应该出台有针对性的相关政策调控房价。房地产行业的供给和需求都离不开金融信贷的支持，信贷扩张会导致房价上涨，相反房价上涨也会造成金融信贷的膨胀。本文利用北京市和重庆市1996年至2012年的年度数据，采用协整关系分析和误差修正模型对两市的金融信贷和房地产价格间的关系进行分析。从而得出两个变量之间的长期关系及短期动态关系，同时将全国数据的分析结果作为参照基准。研究发现，全国、北京市和重庆市金融信贷与房价之间都存在长期稳定关系，但两变量相互影响的方向有很大区别。短期来看只有北京市的金融信贷和房价之间存在短期的因果关系。说明在不同区域条件约束下金融信贷与房地产价格并无一致关系。在此研究结果的基础上，本文针对北京市和重庆市的实证研究结果特点提出了有差异性的控制房价的相关政策。