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水生真菌(Aquatic fungi)是指整个生活周期或部分生活周期依赖于水环境的真菌。水生真菌在物质循环和碳循环、水生生态系统动力学中都起着重要作用,它能分解和软化水体中的木质基质,释放营养物质,其菌丝体能供给无脊椎动物食用。本文所述的水生真菌专指子囊菌及其无性型。真菌种类繁多,2011年,Blackwell通过宏基因技术估计约有510万种真菌,研究较多的绝大部分是陆生真菌,对于水生真菌的研究相对较少,截止2013年报道的水生真菌约有3000种,在中国水生真菌的研究更为缺乏,已报道的水生真菌约有800余种。本文采用定点投放诱饵和随机采样方法,调查大理鸡足山、永平宝台山国家级自然保护区的水生真菌多样性,并分析多样性及群落结构与海拔、基质之间的关系。结果如下:1.从鸡足山随机采集的沉水腐木、诱饵龙竹(Dendrocalamus giganteus)和龙爪柳(Salix matsudana)各80份样本中,共鉴定出水生真菌62属126种,其中子囊菌21种,丝孢菌105种。检出率较高的种为Sporidesmiella hyalosperma(12.50%)、Veronaea botryosa(9.58%)、Sporidesmium macrurum(6.67%)、Acrodontiella fallopiae(4.58%)、Dactylaria biguttulata(4.58%)、Verticilium tenuissimum(3.33%)。2.从宝台山随机采集的沉水腐木、诱饵龙竹(D.giganteus)和龙爪柳(S.matsudana)各80份样本中,共鉴定出水生真菌40属56种,其中子囊菌11种,丝孢菌45种。检出率较高的种为Sporidesmiella hyalosperma(19.17%)、Aquanectria mengla(7.50%)、Aqualignicola hyalina(6.67%)、Dactylaria biguttulata(2.50%)。3.鸡足山、宝台山水生真菌的多样性指数分别为4.19、3.08,两个自然保护区的群落相似指数(S’)为0.20,共有种12种,表明鸡足山水生真菌的多样性比宝台山高,且二者群落差异大。4.鸡足山各采样点的海拔分别为:1890米、2260米、2310米、2440米,多样性指数(H’)依次为:3.42、3.58、3.09、3.28,宝台山采样点的海拔分别为:1687米、2025米、2213米、2450米,多样性指数(H’)依次为:2.22、2.57、2.50、2.29,由于各采样点间海拔梯度相差不大,结果显示海拔与水生真菌多样性的相关性不强。5.在鸡足山随机采集的沉水腐木、诱饵龙竹(D.giganteus)和龙爪柳(S.matsudana)多样性指数分别为:4.11、2.85、2.72,沉水腐木与龙竹(D.giganteus)、沉水腐木与龙爪柳(S.matsudana)、龙竹(D.giganteus)与龙爪柳(S.matsudana)上水生真菌的群落相似性指数分别为:0.14、0.06、0.14。宝台山的沉水腐木样品与诱饵的多样性指数分别为:3.25、1.82、2.10,沉水腐木与龙竹(D.giganteus)、沉水腐木与龙爪柳(S.matsudana)、龙竹(D.giganteus)与龙爪柳(S.matsudana)上的群落相似性指数为:0.20、0.17、0.06。以上数据表明随机采集的沉水腐木上水生真菌的多样性比诱饵的高,沉水腐木与诱饵、诱饵龙竹(D.giganteus)与龙爪柳(S.matsudana)间群落相似性低,表明基质会影响水生真菌的多样性及群落结构。6.根据形态特征及分子数据建立了Helminthosporium属最新的分子系统发育树,并介绍了新种H.submersum。7.本文对25种水生真菌进行了详尽的描述,并附有相应图版,目的是展示鸡足山及宝台山水生真菌的多样性,为水生真菌资源后续的开发利用奠定基础。