背景及目的:胃癌是一种恶性肿瘤,术后的5年生存率为20-35%。目前,基于5-氟尿嘧啶（5-fluorouracil,5-FU）的辅助放化疗是胃癌患者术后的首选治疗方案。由于肿瘤的异质性,不同患者接受该治疗方案后的生存结局差异较大。因此,亟需识别一个标志来预测胃癌患者术后接受5-FU辅助放化疗后的生存,为胃癌患者的临床治疗提供重要参考。方法:本研究共收集了来自芯片和二代测序平台检测的1252例胃癌和84例胃癌的癌旁正常样本。其中,577例胃癌样本和84例癌旁正常样本作为训练集,另外675例胃癌样本作为验证集。首先,基于样本内基因表达水平的相对高低秩序关系（relative expression orderings,REOs）,应用训练集中的361例胃癌样本和84例癌旁正常样本识别出144170个胃癌相对癌旁正常样本REOs逆转的基因对。其次,应用训练集中216例接受术后5-FU辅助放化疗的样本,筛选出与胃癌总体生存（overall survival,OS）时间显著相关的631个逆转基因对。然后,根据贪婪算法,从631个基因对中进一步筛选出34个基因对作为胃癌术后接受5-FU辅助放化疗的最优预测标志（C-index=0.754）。最后,在独立数据集中验证筛选出的标志,并分析不同预后亚型患者间的差异表达基因及其生物学功能。结果:在训练集中,我们识别了由34个基因对构成的胃癌接受5-FU辅助放化疗后的生存预测标志（34-GPS）,并在三个独立的验证集中进行验证。结果表明,在数据集GSE26253＿ACRT中,34-GPS区分的高、低风险组间的OS时间具有显著差异（log-rank P=0.033,HR=1.8223,95%CI,1.100-2.994）,且高风险组样本的生存时间比低风险组样本的生存时间显著更短。同样地,在GSE62254＿ACRT（logrank P=0.028,HR=7.430,95%CI,0.910-60.660）和TCGA＿ACRT（log-rank P=0.042,HR=4.212,95%CI,0.978-18.130）中也观察到类似的结果。本研究对患者的无病进展生存时间（disease free survival,DFS）/无复发生存时间（recurrent free survival,RFS）也进行了分析,与应用OS时间分析的结果相似。利用多因素COX比例风险回归模型对性别、年龄和癌症分期等临床信息进行校正后发现34-GPS的预测效能独立于其他的临床因素。此外,本研究也使用34-GPS对胃癌患者接受其他治疗方案（单纯手术和单纯化疗）后的生存进行了预测,结果表明该预测标志不能预测仅接受手术治疗的胃癌患者的预后,但是它对接受5-FU化疗后的胃癌患者的生存具有一定的预测效能。接着,我们在34-GPS分类的高低风险组间识别出了21个可重复的差异表达基因,分析发现这21个基因均在高风险组的样本中高表达,且主要富集在多个肿瘤进展以及胃癌侵袭、转移相关的信号通路。应用蛋白质互作网络对这21个差异基因进一步分析发现它们与5-FU放化疗的耐药相关。结论:本研究识别的胃癌术后接受5-FU放化疗的生存预测标志能够准确地预测对5-FU放化疗生存受益的患者,为胃癌患者制定有效的个性化治疗方案提供重要的参考。