在全球一体化背景下,一个国家和地区不断发展的关键就是本地区的核心竞争力,而培育当地的自主创新能力则是提升核心竞争力的关键。长三角作为我国重要的经济枢纽,经济发展在全国处于领先地位,具备区域高质量一体化发展的优势。然而长三角区域内各个城市创新发展水平参差不齐等问题,影响了区域长远规划目标的实现。要实现区域内各城市的高质量协调发展,就需要建立新型的区域协调发展模式、建立城市间合作创新机制、完善对创新主体的支持政策等。所以,在保证市场为主导的前提下,地方政府也必须发挥相应的引导和带动作用,而地方财政科技支出则是其最直接的手段。因此,探索地方政府财政科技支出和区域创新能力的关系对政府实现合理调控,推动区域协调发展具有重要意义。此外,由于长三角地区是我国区域一体化发展的标杆地区,对长三角地区研究得到的结论可以为国内其他地区实现创新协调发展,政府合理调控提供一些有益的参考。本文从梳理国内外相关文献、概念及基础理论入手,通过建立相关的理论模型演绎财政科技支出对创新能力的关系,并揭示了地方财政科技支出对本区域和相邻区域创新能力的影响机理。之后从总量和结构两方面对长三角地区近10年的财政科技支出状况进行了分析。在此基础上,以各市专利授权量为中介变量,阐释了长三角内各城市创新能力发展程度和发展差异的时空演变,建立静态和动态的空间计量模型,对地方财政科技支出对本地及邻地创新能力的影响进行了实证分析,并对模型进行了稳健性检验。构建的理论模型结果表明:（1）财政科技支出对企业资金的挤出效应总是存在的,并且其弹性受区域内初始条件的影响;（2）不同地区的产品替代弹性大于1是财政科技支出对创新能力具有正向的溢出效果的充分条件。对长三角财政科技支出状况的分析可以得到该地区仍存在财政科技支出相对强度较低;对基础研究及科技交流方面的投入不足;创新能力低的地区对科技支持服务方面投入不足和财政资金使用效率较低等问题。从创新能力的空间分布看,长三角区域内有以上海为核心的创新极点城市群和分别以皖北和赣东北为主体的两个创新洼地城市群;各城市的创新能力的历年发展存在路径依赖现象,创新能力分布呈现出明显的马太效应;区域创新能力和当地经济水平有相似的区位分布。实证结果表明:当研究对象是长三角全部的55座城市时,创新产出产生了显著的负向空间相关性,但在视角缩小到上海市周围的16座城市时,创新产出却呈现出正相关状态;地方财政科技支出对区域内和相邻区域的创新能力产生均积极作用;人力资本的邻地影响不显著;地区经济发展水平本地效应为正但邻地效应为负;当地的基础建设水平对邻地创新能力呈现出显著的负效应;地区金融发展水平和产业聚集度的本地、邻地效应均为正;社会R＆D支出对邻地的影响没有通过显著性检验。之后依据实证结果并结合实际情况提出了各城市间应当进一步完善区域创新合作平台;进一步完善地方财政科技支出结构;长三角区域内二线城市应当和核心城市联合推出人才政策以增强人才吸引力;各城市应因地制宜确定财政支出重点方向等相关政策建议。