在知识经济、网络技术和信息科技迅速发展的全球化背景下，组织形态发生了巨大变化。根据组织理论原理，组织结构与组织环境的协调一致是组织发展的前提，那么，组织在知识爆炸和技术创新的今天，要应对复杂、动态的环境变化，及时修正战略目标的同时更加需要一个具有弹性的组织结构。所以，企业组织结构整合是顺应组织结构的发展过程，也是企业发展的关键转折点，选择适合的组织结构有利于企业改善组织内部的合作关系，提高企业的竞争力。　　本文在梳理组织结构理论、模块化相关理论的基础上，以改善公司内部组织的合作关系为目的，将模块化方法应用于组织结构整合，重点是研究模块化整合的选择和模块化组织的协同实现。模块化整合的基础研究包括组织结构整合的动因分析，组织模块化分解的可行性以及组织基本模块的设计。在此基础上，对模块化整合的思路、原则、步骤进行深入的研究分析，绘制了模块化组织整合流程图，为实际应用提供指导。为保证模块化组织系统高效的运行，顺利的开展各项业务活动，文章借鉴协同理论，研究了复杂结构的模块化组织中协同的必要性、协同的类型、协同的管理机制以及机构的设置。在文章的最后，选取了YZ公司的组织变革进行分析，找出YZ公司运行过程中的问题、模块化整合的原因，结合理论成果，明晰整合思路，按照整合步骤构建YZ公司模块化组织体系，并试图从三个维度选择出评价组织的关键指标，建立测量体系，检测新的组织结构是否满足YZ公司发展的要求，从而提高模块化整合的效率和效果。　　本文选取了一个全新的角度，通过组织内部的模块化研究，为企业组织结构变革提供了一个新的思路和方向，组织可以通过这种方式逐步实现整个系统的创新。模块化将有可能彻底改变现存的产业结构和组织结构，对经济发展具有十分强大的冲击力。