黄花倒水莲内生真菌活性鉴定及基因组测序分析

来源 :广西师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:nwhitewolf
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
黄花倒水莲是一种富含皂苷、黄酮、多糖等活性成分的远志科远志属药用植物,而药用植物内生真菌被认为是获得新的药用活性物质的重要资源库。前期研究发现黄花倒水莲内生真菌多样性较为丰富,为了更好的挖掘和利用内生真菌,本研究以黄花倒水莲内生真菌为研究对象,利用平板对峙法评价内生真菌对6种植物病原真菌的抑制活性,并通过DPPH自由基清除能力和总还原能力指标评价内生真菌的抗氧化活性,进一步筛选出两株高活性内生真菌HNLF-5和HNLF-44,然后对这两株内生真菌进行鉴定归属。之后采用生长速率法测定这两株内生菌株的乙酸乙酯粗提物和30倍浓缩发酵液的抑菌活性,并利用种子萌发法初步检测发酵液原液和30倍浓缩发酵液的化感效应。最后对具有重要研究价值的菌株进行全基因组框架测序,对测序结果进行基因注释并利用anti SMASH预测次级代谢产物合成基因簇及产物。主要研究结果如下:1.通过平板对峙法从21株黄花倒水莲内生真菌中筛选到了具有显著抑菌活性的HNLF-5和HNLF-44菌株,两株菌株对香蕉专化尖孢镰刀菌、柑橘树脂病菌、茄病镰刀菌、叶点霉病菌、三七根腐病菌、香蕉具条叶斑病菌的抑菌率在50.3%~91.4%之间。其中HNLF-5对6种病原真菌的抑菌率在50.3%~73.2%之间,对柑橘树脂病菌的抑菌效果最好,抑菌率为73.2%;其次为叶点霉病菌,抑菌率为70.3%。HNLF-44的抑菌率则在60.7%~91.4%之间,对香蕉专化尖孢镰刀菌的抑菌效果最好,抑菌率为91.4%;其次为柑橘树脂病菌,抑菌率为67.7%,这表明内生真菌HNLF-5和HNLF-44具有良好的抑菌活性。经形态学结合分子生物学鉴定显示HNLF-5为间座壳属(Diaporthe sp.)真菌,HNLF-44为链格孢属(Alternaria burnsii)真菌。2.13株内生真菌抗氧化活性测定结果显示,发酵原液的DPPH清除率几乎都能达90%,总还原能力吸光度范围为0.279 2~0.748 8;对发酵原液进行乙醇醇沉后的DPPH清除率范围为67.22%~85.65%,总还原能力吸光度范围为0.216 7~0.353 3;对发酵原液进行乙酸乙酯萃取后的DPPH清除率范围为31.13%~45.23%,总还原力吸光度范围为0.132 1~0.247 6。3.对菌株HNLF-5和HNLF-44的发酵物进行活性测定,结果如下:(1)HNLF-5乙酸乙酯粗提物的抑菌活性随着浓度的增加而增强,当浓度为10 mg/m L时,对香蕉专化尖孢镰刀菌、香蕉具条叶斑病菌、柑橘树脂病菌和叶点霉病菌的抑制率分别为43.3%、59.1%、60.1%和49.47%;而30倍浓缩发酵液的抑菌活性较差,抑菌率分别为12.1%、20.8%、12.4%和32.4%。HNLF-44的乙酸乙酯粗提物对6种病原真菌的抑菌活性较差,抑菌率都在29.1%以下;而NLF-44的30倍浓缩发酵液对香蕉专化尖孢镰刀菌具有70.3%的抑菌活性,但对其他病原菌的抑制活性较差,抑菌率为18.9%~31.5%。(2)HNLF-5和HNLF-44发酵液原液对油菜种子发芽期的根长、芽长起促进作用,HNLF-5处理的种子根长、芽长与对照组相比增加了0.6%和1.1%,HNLF-44处理的则增加了0.3%和27.5%。而HNLF-5和HNLF-44的30倍浓缩发酵液对油菜种子的发芽率、根长和芽长均起到抑制作用,HNLF-5的抑制率为24.3%(发芽率)、24.2%(根长)和8.0%(芽长),HNLF-44为41.8%、86.0%和17.4%。4.利用二代测序技术对HNLF-44进行全基因组测序,并对其进行功能注释和预测次级代谢产物合成基因簇。结果表明,HNLF-44菌株的基因组大小为28671348 bp,GC含量为51%,共有10692个编码基因参与到GO、KOG、KEGG注释通路中,有1005个基因被注释到碳水化合物活性酶家族(CAZy)中。在HNLF-44基因组中预测到了28个次级代谢产物合成基因簇,其中8个已知的次级代谢产物合成途径与T1PKS(I型的聚酮合酶基因簇)、NRPS(非核糖体肽合成酶)、terpene(萜烯类合成途径基因簇)这三条途径相关,可能产生的次级代谢产物有链格孢吡喃酮(alternapyrone)、交链格孢酚(alternariol)、黑色素(melanin)、菊苣碱(cichorine)、脱落酸(abscisic acid)、二甲基粪卟啉(dimethylcoprogen)、TAN-1612/1-(2,3,5,10-tetrahydroxy-7-methoxy-4-oxo-1,2,3,4-tetrahydroanthracen-2-yl)pentane-2,4-dione/desmethyl TAN-1612和角鲨烷抑制剂S1(squalestatin S1)。本研究表明黄花倒水莲内生真菌具有良好的抑菌活性、抗氧化活性等,为今后其内生真菌的开发应用提供了理论基础。
其他文献
高校教师科研评价是高校科研管理的核心环节,基于2000年以来近20年的中国知网(CNKI)的文献分析,发现高校教师科研评价形成本源性、现实性和可能性三类研究取向,表现为与高校教师科研评价有关的性质作用、评价体系和评价制度等多维学术图景。文献计量分析法进一步表明,该领域具有发文数量日益增多、发文学术共同体分散和发文载体刊物相对单一等基本特点。展望未来,应在加强学科交叉、丰富研究内容、提升研究方法和建
期刊
目的:分析贵州省人民医院儿科2019年和2020年下呼吸道感染住院患儿病原菌的分布情况、对抗菌药物的耐药情况、抗菌药物的应用情况以及新冠疫情防控措施对病原菌分布情况的影响,以指导临床抗生素的合理使用。方法:收集贵州省人民医院儿科2019年1月~2020年12月因下呼吸道感染性疾病住院并送检下呼吸道病原学检查的14533例痰和肺泡灌洗液的细菌培养结果,运用IBM SPSS Statistics 26
学位
目的 研究立体水杨酸在兔耳痤疮模型中的治疗作用。方法 雄性家兔15只,随机分为空白对照组、模型对照组、0.1%阿达帕林组、2%水杨酸组2%立体水杨酸组。于兔耳内侧面耳导管开口处每日涂抹2%煤焦油1次,连续14 d制备兔耳痤疮模型。随后每日于病灶处涂抹药物1次,连续21 d,每日观察兔耳皮肤,给药结束后进行组织活检。结果 造模后可见兔耳皮肤毛囊处有角栓、红色丘疹形成。组织病理学可见毛囊面积明显扩大,
期刊
目的探究小檗碱通过抑制细胞焦亡减少结肠炎引起的肠黏膜屏障损伤的机制。方法1.首先采用葡聚糖硫酸钠诱导的小鼠结肠炎体内模型使用葡聚糖硫酸钠(Dextran sulfate sodium,DSS)诱导的小鼠结肠炎构建溃疡性结肠炎模型;2.C57BL/6J小鼠进行3d适应性喂养后,将其用随机数字表法随机分为7组:(1)正常对照组(Normal);(2)DSS组(DSS);(3)DSS+小檗碱组(D+BB
学位
PA2019NES是铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa,PA)野生菌株PA 2016NX1的工程菌株,其吩嗪类物质产量较野生菌株高44.4%,而吩嗪能有效抑制植物病原真菌并增强植物抗旱能力,很有农用开发前景。本实验通过测量不同处理的玉米整株鲜重等,判断铜绿假单胞菌对植株耐旱性能的影响,探究PA2016NX1和PA2019NES与玉米互作状态下其多拷贝phz R基因对六型分泌
学位
目的:通过生物信息分析筛选出与皮肤黑色素瘤(Skin cutaneous melanoma,SKCM)预后相关的免疫微环境相关基因,构建一种新的风险评分模型,为预测SKCM患者的预后及研究新的免疫治疗靶点提供理论依据。方法:基于癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)下载SKCM的转录组数据,通过ESTIMATE算法、单样本基因集富集分析(Single-sampl
学位
目的:经皮冠状动脉介入治疗(PCI)作为冠心病的主要治疗手段,在治疗急性冠状动脉综合征的效果已被证实;而对于稳定性心绞痛患者,在随访治疗中何时行PCI治疗,以及PCI是否能使患者获益,国内外争议很大。本课题通过回顾性研究探讨无创影像特征(冠脉CT血流储备分数、冠周脂肪衰减指数)在评价稳定性心绞痛行PCI治疗中的价值。方法:回顾性收集2018年10月至2021年12月于我院第三代双源CT接受CCTA
学位
柑橘黄龙病(Citrus Huanglongbing,HLB)又称黄梢病、叶斑驳病、青果病,是一种广泛存在于中国亚热带地区及其他柑橘主产区的一种系统性侵染的细菌性病害,它能够侵染各种柑橘类植物并使其逐渐衰退并死亡。目前在我国广东、广西、福建等11个省份均有发生,这严重制约了柑橘产业的发展,给研究者和生产者带来巨大挑战。柑橘黄龙病病原菌目前还无法体外纯培养,产业上也没有耐(抗)病柑橘品种可以用。因此
学位
<正> 例1.班××,女,39岁。1983年12月15日诊。患者于四个月前突然全身浮肿,经××医院诊断为“急性肾小球肾炎”,住院治疗三月后出院。两天前发现下肢浮肿,腰间酸楚,精神疲惫,四肢乏力,口干不饮,手脚心热,小便短赤。尿检:蛋白(十),白细胞(廿),红细胞1~2/高。舌质淡,尖色黯,苔薄白,脉沉细略数。证属气阴两虚,水湿潴留。治宜益气养阴,扶正治本。方用生地六味汤加味:
期刊
目的:本研究将在了解并分析孕妇在不同膳食摄入基础上的营养补充剂使用现状,为孕妇科学合理使用营养补充剂提供参考依据。方法:采用流行病学横断面调查方法,选取2017年6月-2020年6月淄博市来自城市和农村地区符合纳入条件的孕妇为研究对象,采用24小时膳食回顾法调查并分析孕妇膳食中营养素摄入量,同时调查孕妇营养补充剂的使用品规、数量、时间,计算孕妇每日营养素摄入总量。结果:1.本研究共纳入660名孕妇
会议