花生栽培种SSR遗传连锁图谱构建及重要产量性状QTL定位分析

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花生是人类重要的植物油脂来源,也是世界上广泛种植的油料作物与经济作物。我们平时所说的花生栽培种是异源四倍体,其在形态、生理、农艺性状等方面都有着十分丰富的差异,说明栽培种花生在DNA水平上也应该存在较大变异。然而由于花生基因组较大、且结构相对复杂,花生遗传研究开展较晚,目前花生DNA分子标记研究明显落后于许多其它重要作物。随着现代分子生物学技术的发展,尤其是高通量分子标记技术、生物信息技术和能够高速运行计算机的发展与应用使得需要庞大工作量的图谱构建及QTL定位工作成为现实。基于SSR分子标记构建花生遗传连锁图谱并对产量性状进行QTL定位,进而开展分子标记辅助育种,将有助于明显提高育种效率,加快花生优良品种的选育进程。本研究以花生栽培品种白沙1016和花生属四倍体野生种(A.monticola)为研究材料,首先通过杂交和F2单粒传法(SSD)构建了包含215个家系的RILs群体,该群体已经推进至F11;基于SSR分子标记,运用JoinMap4.0构建了该群体的分子遗传连锁图谱,并结合该群体产量性状相关的表型数据,运用WinQTLCart2.5软件进行了重要产量性状的QTL定位研究,获得了一系列有价值的研究结果:1.运用2405对SSR引物在重组自交系群体(白沙1016×A.monticola)的双亲中进行多态性检测,共检测到302对引物在双亲间具有明显多态性,其多态性频率为12.6%。构建了花生栽培种分子遗传连锁图谱,该图谱总图距为1440.4cM包含22个连锁群,282个SSR标记,标记间平均距离为5.1cM。其中最长的连锁群包含标记36个,长度为236.3cM,最短的连锁群有2个标记,长度为3.2cM。SSR分子标记在连锁群上分布不均,共有7个连锁群(分别为第2、4、5、7、8、14、15连锁群)上出现了图距大于20cM的间隙,最大间隙达到了37.2cM,位于第14连锁群上。在第1、2、3、8、9、11连锁群上,出现了不同程度的SSR标记密集区。2.利用SSR遗传连锁图谱结合RILs群体在三个不同环境(郑州、商丘、驻马店)的总分枝数、单株饱果数、结果枝数、百果重、单株果重、百仁重、出仁率等七个重要产量相关性状的调查数据,运用WinQTLCart2.5软件的CIM作图法对这些性状在不同环境中进行QTL检测,得出以下结论:在郑州环境中检测到31个QTLs与7个性状指标相关,单个QTL的贡献率在3.34%~20.98%之间;在商丘环境中检测到7个性状的27个QTLs,单个QTL的贡献率在3.53%~15.89%之间。在驻马店环境中检测到6个性状的14个QTLs,单个QTL的贡献率在3.52%~15.28%之间,没有检测到与总分枝数有关的QTLs。结合三个环境下的QTL检测结果,发现位于Lg19上的标记ARS445附近的QTLs与百果重、百仁重和单株果重都紧密连锁,表现为正向加性效应。
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