公司治理是现代企业制度建设的重要组成部分，也是理论界和实务界研究的热点问题。良好的公司治理，起到降低企业代理成本的作用，而且可以保证公司决策的科学性和有效性，有利于企业绩效的提高。 民营上市公司作为中国证券市场的重要组成部分，其治理结构的完善和健康发展对我国证券市场乃至国民经济的发展起到至关重要的作用。现有的关于民营上市公司的治理的研究仍停留在把民营上市公司作为一个整体来考察公司治理问题，对不同类型公司的差异未给予充分关注，未深入研究不同类型民营上市公司公司治理状况和特征。 本文针对不同的上市方式，将民营上市公司划分为家族控股上市和兼并重组上市两个子样本，在总结了公司治理理论的基础上，以翔实丰富的数据为支撑，考察和比较了股权结构、董事会、监事会、经理层激励等内部公司治理结构的特征，并利用2005年～2007年的面板数据进行回归分析。 实证研究发现两类民营公司的治理结构虽然在形式上比较完备，但是有些机制并没有发挥效用，如其他大股东并没有对控股股东起到制衡作用，经理层的持股没有起到有效的激励作用。两类民营上市公司在第一大股东持股比例、独立董事比例、董事会会议次数等治理机制上表现出区别。 在实证实检验的基础上，结合我国民营上市公司治理的特点，本文最后提出了完善民营上市公司治理的相关政策建议。