姬鼠有很长的进化历史，并且其进化历史被认为与全球地质变迁、植物区系演替有关。横断山脉具有最复杂的水系、山系及复杂的地质历史。本文以横断山脉为主要分布区的澜沧江姬鼠（Apodemus ilex）和横断山脉的特有种大耳姬鼠(Alatronum)为研究对象，旨在探讨这两种姬鼠的形态分化。　　 本研究对308号澜沧江姬鼠成年头骨标本及188号大耳姬鼠成年头骨标本的16个变量进行了测量，利用多变量和单变量分析方法，对两种姬鼠的头骨形态分化进行了研究。分析表明澜沧江姬鼠可分为6个居群：高黎贡北、高黎贡南、永德大雪山、云岭南、云岭北和东川轿子山；而大耳姬鼠可分为4个居群：川西藏南、川中南、滇西北和滇东北。并且差异主要体现在下臼齿列长(CLLMR)、上臼齿列长(CLUMR)、上臼齿横宽(MI-MI)、第一上臼齿长(LMl)、下齿列长(LLTR)和眶间宽(IB)等6个与咀嚼、咬合能力有关的变量，表明食性差异在姬鼠类群适应性进化中扮演着重要角色。