sLR11基因SNPs与T2DM及合并颈动脉硬化的相关性研究

来源 :延边大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:miss3yoyo
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目的:探讨延边地区可溶性低密度脂蛋白受体11(sLR11)基因单核苷酸多态性(SNPs)rs641120、rs2070045、rs3824968位点在延边地区朝、汉族人群中与2型糖尿病(T2DM)合并颈动脉硬化之间的相关性。研究对象及方法:采用病例对照设计,随机采集延边地区朝鲜族和汉族T2DM患者共计313例,正常对照组(NGT组),朝鲜族24人,汉族52人,共计76例。T2DM组分无颈动脉粥样硬化组(NCAS组),朝鲜族16人,汉族88人,共计104例,颈动脉粥样硬化组(CAS组)朝鲜族36人,汉族97人,共计133例。采用多普勒彩色超声仪测量颈动脉内膜-中层厚度(IMT)及有无斑块。使用全血基因组DNA提取试剂盒提取目的基因组。通过LDR-PCR技术进行SNP分型及测序。利用单克隆抗体sLR11试剂盒检测sLR11水平。运用Hardy-Weinberg平衡定律,确定研究样本的群体代表性,采用连锁不平衡(LD)筛查sLR11基因标签SNP(TagSNP)。结果:1.连锁不平衡分析结果:对sLR11基因3个SNP(rs641120、rs2070045、rs3824968)的D’值和r2值绘制了 LD图谱,结果显示rs2070045与rs3824968之间存在强连锁不平衡(D’=0.972,r2=0.92),与rs641120之间不属于连锁平衡(D≠0),rs2070045为本次研究的sLR11基因设计的3个SNP的TagSNP。2.sLR11基因 3 个 SNP(rs3824968、rs2070045、rs641120)在 NGT 组、NCAS 组和 CAS组中等位基因频率和基因型频率均已达到遗传平衡(P>0.05),具有群体代表性。3.等位基因频率和基因型频率分布比较:3个位点等位基因频率和基因型频率在朝鲜族和汉族之间无差异(P>0.05)。因此,全部样本sLR11基因的3个位点等位基因和基因型病例对照关联性分析时不分朝鲜族和汉族。结果显示,携带sLR11基因rs3824968、rs2070045、rs641120位点等位基因和基因型频率频率NGT组、NCAS组与CAS组,未发现差异(P>0.05)。4.单体型分析结果:sLR11基因3个SNP rs3824968、rs2070045、rs641120存在6种单体型。在NGT组与NCAS组间有显著性差异的风险单倍型有CTA与TGT,保护单倍型有CTT与TGA。在NGT组与CAS组间存在显著性差异的风险单倍型有CTA,保护单倍型有CTA、CTT、TTT、GGT,在NCAS组与CAS组中有显著性差异的风险单倍型有CGA、TGT。5.阳性的联合基因型与各指标关联分析:将sLR11基因的3个SNPs联合作用进行比较,随机组合能够形成27种基因型组合,理论存在实际未测得数据未列入统计,共获得23组基因型。(1)携带CC-GT-AT联合基因型的频率在NGT组大于CAS组,NCAS组大于CAS组,提示携带CC-GT-AT联合基因型可能具有保护NGT及NCAS组人群罹患CAS的作用。(2)携带CT-GG-AA联合基因型的频率在CAS组大于NCAS组,提示该基因型增加了 NCAS组合并CAS风险增加3.504倍。(3)CT-GT-AT联合基因型的频率在NGT组大于NCAS组,提示该基因型可能具有保护NGT人群罹患T2DM作用。(4)TT-GG-AA联合基因型的频率在NGT组显著大于NCAS组,提示该基因型可能具有保护NGT人群罹患T2DM作用,但是携带TT-GG-AA联合基因型的频率在CAS组大于NCAS组,罹患CAS的风险增加2.598倍,提示罹患T2DM患者中一旦携带TT-GG-AA基因型可能促发CAS。(5)TT-GG-AT联合基因型的频率在NCAS组大于CAS组,提示可能具有保护NCAS患者合并CAS的作用。6.阳性基因型与检测指标进行病例-对照关联分析示CT-GG-AA联合基因型FPG 水平在NGT组,NCAS组与CAS组间存在统计学差异(P<0.05),NCAS组与CAS组高于NGT组。CT-GT-AT联合基因型在SPB、FPG、TG水平在三组中存在统计学差异(P<0.05),SPB、FPG水平在NCAS组与CAS组高于NGT组,TG水平在CAS组高于NGT组。TT-GG-AA联合基因型在BMI、SPB、FPG水平在三组中存在统计学差异(P<0.05)。BNI、FPG水平在NCAS组与CAS组高于NGT组,SPB水平在CAS组高于NGT组。7.CAS组中sLR11与全部指标的相关性分析:sLR11与其他临床指标未见明显相关性,差异未见统计学意义。结论:1.sLR11基因SNP rs3824968、rs2070045、rs641120可能是延边地区朝鲜族与汉族罹患T2DM及CAS的易感基因,其联合作用可能与T2DM及动脉硬化的发生有关。2.单倍型CTA及TGT可增加人群罹患T2DM的风险,T2DM患者携带CGA、TTA单倍型可增加罹患CAS的风险。3.联合基因型CT-GG-AA可增加T2DM患者合并CAS风险。TT-GG-AA基因型可能是罹患T2DM的保护基因型,但是罹患T2DM患者中一旦携带此基因型可能促使朝向CAS发展。
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