蛋白质在晶体界面上吸附的分子动力学模拟

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蛋白质的吸附现象很早就被人们发现,并已经在生物医学材料、生物医学工程等领域得到广泛应用。分子模拟技术是近年来发展起来的一门新兴技术,为从微观水平研究自然现象提供了一种十分有效的理论研究方法。其中的分子动力学模拟方法不仅可以用来研究系统的静态性质,还可以研究系统的动态过程,是蛋白质结构研究中的重要理论工具之一。采用分子动力学模拟方法研究蛋白质吸附过程,可以从微观水平上研究蛋白质吸附的动态过程和机理。在NVT条件下,采用TIP3P水分子模型和CHARMM22力场,对聚十赖氨酸分子在金刚石、金、铜、氯化亚铜、氧化镁等晶体界面上的吸附过程进行了分子动力学模拟。模拟结果表明,蛋白质分子在这些晶体界面上的吸附过程中,主链的构象均发生了变化,蛋白质分子中α螺旋结构也有不同程度的减少。但界面性质对蛋白质的吸附过程有重要影响,在不同的晶体界面上,吸附过程中的蛋白质结构变化有较大差异。在金刚石晶体界面上吸附时,聚十赖氨酸分子构象变化最大,绝大部分二面角都超出了α螺旋的范围;在Au晶体界面上吸附时,构象变化相对较大,α螺旋含量也有较大程度的减少;在Cu和CuCl晶体界面上吸附时,也有一定程度的构象变化和α螺旋含量的减少;在MgO晶体界面上吸附时构象变化最小,与α螺旋结构相差不大。研究结果对于蛋白质吸附机理的研究提供了理论基础,对蛋白质吸附在实际中的应用具有重要的指导意义。
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