苏云金芽胞杆菌(Bacillusthuringiensis，Bt)是一种昆虫病原菌，革兰氏阳性，在芽胞期可形成伴胞晶体，其杀虫活性主要由伴胞晶体体现，构成伴胞晶体的Cry蛋白在使昆虫肠道细胞穿孔，从而杀死宿主。苏云金芽胞杆菌能有效毒杀鳞翅目、双翅目、鞘翅目等昆虫，得到广泛研究和关注，并被发展为重要的生物杀虫剂，同时也是构建转基因抗虫植物重要的基因来源。　　苏云金芽胞杆菌分布于各种自然生态环境中，从土壤、昆虫、灰尘和叶片等样本中均可以分离获得苏云金芽胞杆菌。新疆塔里木盆地生态环境特殊，微生物资源丰富，土壤中细菌含量较高，有着一定比例的芽胞杆菌，其中可能含有丰富的苏云金芽胞杆菌。本研究，出菌率为83.02％，伴胞晶体形态有菱形、圆形、椭圆形等，多为圆形。来源于不同生态环境的土壤样本出菌率不同，土壤盐浓度低、土壤蓄水量高、物种多样、植被丰富的生态环境中出菌率较高。　　csaB基因位于Bt的染色体上，其基因序列的同源性和Bt的血清型密切相关，可以作为确定苏云金芽胞杆菌菌株间的进化关系的分型标准和鉴定Bt菌株的分子标记。这些菌株可能为新的血清型。本研究结果表明，新疆塔里木盆地特殊生境中苏云金芽胞杆菌资源的具有较复杂的生物多样性，这其中蕴含着大量的新型Bt菌株资源。此外，本研究分离的新型Bt菌株资源为后续克隆新型杀虫蛋白基因提供了宝贵的材料。