【摘 要】
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目的:本研究旨在通过数据非依赖性采集（DIA）和酶联免疫吸附试验（ELISAs）筛选脓毒症患者血浆中的差异表达蛋白（DEPs）,为判断脓毒症病情提供方便、准确的血清标志物。方法:本项研究纳入了自2019年01月01日开始至2020年12月31日这两年期间于西南医科大学附属急诊医学部住院并明确诊断为脓毒症的患者53例,以及同时期的健康对照组16例;根据28天的转归情况,将脓毒症患者再分为生存组和死亡
【基金项目】
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四川省省级科技计划项目(脓毒症代谢组学平台建设与生物标志物的筛选,编号:2020YFS0517； BIDOS:脓毒症基因芯片大数据交互式整合平台,编号:2019JDKP0014)；
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目的:本研究旨在通过数据非依赖性采集（DIA）和酶联免疫吸附试验（ELISAs）筛选脓毒症患者血浆中的差异表达蛋白（DEPs）,为判断脓毒症病情提供方便、准确的血清标志物。方法:本项研究纳入了自2019年01月01日开始至2020年12月31日这两年期间于西南医科大学附属急诊医学部住院并明确诊断为脓毒症的患者53例,以及同时期的健康对照组16例;根据28天的转归情况,将脓毒症患者再分为生存组和死亡组;随机从中选择了脓毒症15例和健康对照组6例分别进行了基于DIA方法的定量蛋白质组学分析研究;将所获取到的数据通过GO注释、KEGG信号通路分析,并构建PPI网络以协助筛选出潜在的血浆生物标志物;进一步通过ELISA扩大样本量以验证所选择的目标蛋白质,分析其在健康对照组和脓毒症患者、生存组和死亡组之间的表达情况,并分别绘制两组之间的ROC曲线以评估它们的潜在诊断应用价值和预后效能。结果:采用生物信息学方法对获得的DIA数据进行比对后,在两组间总共识别出149个差异表达蛋白,与健康对照组相比,脓毒症组中131个DEPs表达上调,14个表达下调;GO分析表明,这些差异蛋白质主要参与了细胞运动、应激反应、细胞增殖和免疫反应等生物过程;KEGG通路富集分析表明,它们主要与白细胞跨内皮迁移、蛋白质合成和加工,以及各种细菌感染有关;蛋白-蛋白相互作用网络分析发现了8个位于该网络中心位置的核心蛋白质,分别是:LGALS3BP、CD59、MIF、TIMP1、MMP2、CD44、CD14、LTBP2,通过大量文献检索后LGALS3BP被选为潜在的血浆蛋白标志物;扩大样本量后经ELISA进一步验证表明,LGALS3BP在脓毒症患者中的水平（119.8±32.7 ng/m L）显著高于健康对照组（76.1±49.2ng/m L）,在死亡组中的水平（142.2±27.2 ng/m L）也高于生存组（110.2±30.4ng/m L）;脓毒症组与正常对照组两组间的ROC曲线曲线下面积为0.74,生存组与死亡组两组间的ROC曲线的面积为0.80,表明其在脓毒症中具有很好的诊断价值和预后能力。结论:1.通过DIA蛋白定量方法初步建立脓毒症患者及健康体检者的血清的蛋白质普图库,并筛选出了149个差异表达蛋白,与正常对照组相比,脓毒症组中131个DEPs表达上调,14个表达下调;2.通过对差异蛋白进行生物信息分析及制作蛋白-蛋白互作网络发现8个位于该网络中心位置的核心蛋白质,分别是:LGALS3BP、CD59、MIF、TIMP1、MMP2、CD44、CD14、LTBP2,通过文献查询后将LGALS3BP确立为潜在的血浆生物标志物;3.通过ELISA扩大样本量后进一步研究发现,LGALS3BP对脓毒症具有较好的诊断价值,且其表达量随着疾病的进展而逐步增加,与脓毒症的病情严重程度相关,对患者具有一定的预后效能,为研究脓毒症的治疗、疾病严重程度的长期监测和诊断靶点等奠定了必要的研究基础,为临床上对脓毒症的诊断和预后提出了全新的方案。
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