为了满足辣椒种植规模快速发展的需要,解决设施辣椒品种被国外垄断、国内设施优良品种缺乏的问题,辣椒种质资源评价指标与评价方法的研究对辣椒种质资源创新与利用意义重大。本试验在塑料大棚的设施种植条件下对现有的112份可用于选育螺丝椒、牛角椒品种的辣椒种质资源进行农艺性状、品质指标及遗传多样性分析,对评价指标之间的相互关系及种质资源评价方法进行了研究,并通过分子标记对材料进行聚类分析,得出种质资源之间的亲缘关系远近,对设施辣椒育种技术创新、亲本的合理配组和品种选育具有重要的意义。主要研究结果如下:1.对所有材料的30个农艺性状进行调查与统计,多样性指数的变化范围为0.26-2.11,平均值为1.51;叶片宽的多样性指数最大,为2.11;分枝性的多样性指数最低,为0.26。20个可量化性状的变异系数范围是0.07-0.67,平均变异系数为0.39;叶色L的变异系数最小为0.07,青熟果重和单株果个数的变异系数相等为0.67。供试辣椒种质资源变异系数大、遗传多样型指数高,是宝贵的育种资源。通过对主要农艺性状的相关性及主成分进行分析,表明株高与主茎高,叶色与青熟果色,叶片大小,单株产量与分枝性,商品果横径,果肉厚,单株果个数等之间均有极显著相关关系;植株性状和果实性状这两组变量的相关性主要是由株幅、叶片长、主茎高、商品果纵径、青熟果重和单株果个数组成的。主成分分析得到前11个主成分累积贡献率达到75.436%,可归纳为果实性状因子、叶色因子、叶片因子、株型因子、植株茸毛因子、果色因子,为农艺性状的综合评价奠定基础。2.测定了可溶性蛋白、可溶性糖、维生素C、干物质和辣椒素这5项营养成分指标含量,平均含量分别为4.02 mg/g、3.83%、40.91 mg/100g、8.29%、0.04 mg/g。辣椒素的变异系数最大,达到3.74,干物质的变异系数最小,为0.19。基于辣椒素含量测定结果用SHU法对所有辣椒材料进行辣度分析,在1-8等级的辣度中均有分布,其中大部分材料辣度分布在1-2区间,其中材料L44、L85、L54为辣度较高的3份种质资源。对营养及感官品质进行相关性分析,表明干物质与各项感官指标均呈极显著相关关系,其中与辣度呈正相关,与口感和风味呈负相关。可溶性糖、可溶性蛋白、维生素C均与感官品质无相关性关系,感官品质可能主要受干物质以及组织结构等的影响。由典型相关性分析可知,营养及感官品质这两组变量的相关性主要是由干物质和口感组成的,干物质在营养品质中的载荷为-0.913,口感在感官品质中的载荷达到1.088。3.对所有种质资源进行SSR遗传多样性分析,明确了112份设施辣椒种质资源的亲缘关系。27对SSR分子标记共检测到74个等位基因,每对SSR标记检测到2-5个等位位点,平均每个位点能扩增出2.74个等位基因,112份设施辣椒种质资源多样性丰富、遗传基础广泛。用UPGMA法对资源进行聚类分析,在遗传距离为0.34处,可将所有种质资源分为两大类。第Ⅰ类包含有94份材料,第Ⅱ类包含有18份材料。第Ⅰ类在欧氏距离0.30处分为八个亚类;第Ⅱ类在欧氏距离0.285处又被分为四个亚类。总体聚类结果与材料来源及果型分类基本一致,为后续育种工作配组的杂种优势利用奠定基础。4.对辣椒果实、品质性状进行相关性分析可知,辣度、辣椒素含量与果肉厚、商品果横径、果重呈极显著负相关,与果面特征、商品果纵径、果型指数、干物质呈极显著正相关关系;口感、风味与辣椒素、果面特征相关性不显著,与商品果横径、果肉厚、青熟果重呈负相关,与商品果纵径、果型指数呈正相关。对辣椒植株、品质性状进行相关性分析可知,叶色L、叶色a、叶面绒毛、叶面特征、叶片长、叶片宽、首花节位为与设施辣椒品质性状相关的主要植株性状。5.针对设施辣椒果实品质和植株丰产性两个育种目标,建立了2套设施辣椒综合评价体系:（1）建立了设施辣椒果实品质评估标准,并用灰色关联度分析得到N41、L25、N49、L35、L9、L61等与A0等权关联系数较大比较理想的设施辣椒种质资源,对品种的选育具有一定的指导作用。（2）设施辣椒的丰产性通径分析:建立单株产量回归方程,得到共五个性状对设施辣椒种质资源产量有直接贡献,其中,青熟果重、单株果个数、叶色a对单株产量有正向直接效应,商品果横径、干物质对单株产量有直接负向效应。除此以外,果肉厚、商品果纵径、口感、风味、辣度、心室数、叶片长、叶片宽、主茎高这些指标都对产量起到了间接通径效应。