水稻穗形态建成基因的遗传定位

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穗型是水稻产量的决定因素之一。水稻穗由穗轴、一次枝梗、二次枝梗、小穗组成。探究穗发育的分子机理,具有重要的理论意义和实用价值。本课题组前已创建了水稻粳稻品种中花11号(Oryza sativa L.ssp.japonica cv.Zhonghua11)的大型T-DNA突变体库,本研究基于已鉴定的4份穗突变体材料l4、ps19、ps22、ps26,它们均表现为水稻穗形态建成缺陷型突变。利用图位克隆的方法,取得如下基因定位结果:1.ps26表现为植株半矮、小穗、枝梗减少、叶窄的表型。通过T-DNA区段特异引物PCR阳性检测,证明了突变性状不是由于T-DNA插入所导致。利用ps26与籼稻品种Dular(Oryza sativa L.ssp.Indica cv.Dular)杂交所构建的F2群体,采用分离群体分组混合分析的方法,已将基因定位于第10号染色体插入/缺失标记VF22964与VF22008之间,其两侧的物理图距为52kb左右。2.应用二代测序的方法,对ps26和野生表型植株候选基因区段进行分析。结果显示:ps26相较于野生型,在此区段23038207 bp位置处,出现由“C”变为“T”的碱基差异。猜测这可能为ps26突变性状产生的原因。同时,此位点的基因型差异与ps26×Dular F2群体中植株表型共分离。预测PS26为Os SRO1a基因,ps26在该基因处发生了基因突变。3.对于粳稻品种“中花11号”T-DNA插入突变体库中发现的其它3个突变体材料ps19、ps22、l4,证明突变性状均不是T-DNA插入所导致后,通过与籼稻品种珍汕97(Oryza sativa L.ssp.Indica cv.Zhenshan97)配置F2分离群体,采用图位克隆方法对目标基因进行初步定位。研究结果表明:PS19定位于7号染色体标记VF07218与RM21825之间,两侧的物理图距0.45Mb左右;PS22定位于8号染色体标记PS22-H-1与PS22-H-8之间,两侧的物理图距0.12Mb左右;L4初步定位于6号染色体标记VF060174与VF06020之间,两侧的物理图距0.25Mb左右。该结果为后续基因精细定位和克隆奠定了基础。
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